当前解析结果
SmilChr08G001058| 统一新 Gene ID | SmilChr08G001058 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G001058 |
| 描述 | protein S40-4 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 8137623 - 8138514 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131000644 |
|---|---|
| GeneID | 131000644 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131000644 |
| 原始查询 | SmilChr08G001058 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein S40-4 |
| 产物 | protein S40-4 |
| Arabidopsis | AT5G60680 (AT5G60680)transcription initiation factor TFIID subunit (Protein of unknown function, DUF584) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836189] identity=54.8; qcov=1.03; evalue=4.13e-40; confidence=medium |
| Rice | Os04g0520700 (OsS40-13)- identity=44.1; qcov=1.14; evalue=2.78e-31; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF04520 (Senescence_reg) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131000644 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057782640.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057782640.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057782640.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057782640.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057782640.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057782640.1PF04520
Senescence_reg 50-163 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057782640.1 |
Pfam | PF04520 |
Senescence_reg | Family | 50 | 163 | 8.3e-40 | 138.1 | Senescence regulator |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。