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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001063`

染色体: Chr08 坐标: 8209470-8213149 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001063`
名称	SmilChr08G001063
描述	protein disulfide isomerase-like 1-4
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	8209470 - 8213149 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000648`
GeneID	`131000648`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000648`
原始查询	`SmilChr08G001063`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein disulfide isomerase-like 1-4
产物	protein disulfide isomerase-like 1-4
Arabidopsis	`AT5G60640` (PDIL1-4) PDI-like 1-4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836185] identity=66.8; qcov=0.821; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0100100` (PDIL1) - identity=61.8; qcov=0.853; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003756 (protein disulfide isomerase activity); GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0006457 (protein folding); GO:0034976 (response to endoplasmic reticulum stress)
KEGG	smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00085 (Thioredoxin); PF13098 (Thioredoxin_2); PF13848 (Thioredoxin_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000648

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057782643.1`
2	Endoplasmic reticulum lumen	内质网腔	1.00000	`XP_057782643.1`
3	Melanosome	Melanosome	0.20000	`XP_057782643.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782643.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782643.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:8209506`	`T`	`TCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B25,C76,D5
`Chr8:8209506`	`T`	`TCG`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B25,C76,D5
`Chr8:8209537`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B48,C15,C46,C8
`Chr8:8209546`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B139,C2
`Chr8:8209547`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr8:8209549`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,C16,C25,C30
`Chr8:8209582`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B129,B131,B83,C8
`Chr8:8209603`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr8:8209664`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	22	A1,A11,A25,B1,B104,B112,B125,B134,B53,B70,B79,B98,C12,C2,C29,C32,C39,C55,C63,C68,D10,D3
`Chr8:8209674`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B132,C21,D10,D4
`Chr8:8209686`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B121,B60,C31
`Chr8:8209840`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	43	A1,A23,A7,B1,B100,B111,B112,B119,B125,B134,B22,B3,B30,B34,B37,B41,B44,B48,B50,B53,B58,B61,B7,B70,B81,B83,B91,C12,C15,C16,C2,C25,C32,C39,C46,C48,C5,C55,C62,C68,C80,D10,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782643.1

565 aa

282

565

Thioredoxin

Thioredoxin_2

Thioredoxin_6

Thioredoxin

PF00085 Thioredoxin 98-198 aa PF13098 Thioredoxin_2 111-198 aa PF13848 Thioredoxin_6 240-410 aa PF00085 Thioredoxin 436-521 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782643.1`	Pfam	`PF00085`	Thioredoxin	Domain	98	198	6.9e-57	190.5	Thioredoxin
`XP_057782643.1`	Pfam	`PF13098`	Thioredoxin_2	Domain	111	198	1.4e-11	45.4	Thioredoxin-like domain
`XP_057782643.1`	Pfam	`PF13848`	Thioredoxin_6	Domain	240	410	5.2e-32	111.9	Thioredoxin-like domain
`XP_057782643.1`	Pfam	`PF00085`	Thioredoxin	Domain	436	521	6.9e-57	190.5	Thioredoxin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926660.1
ATGGCGACTAGAATCACTCTGCCACTCCTACTTCTCTCTCTCCTCCTCTTCTCCCTCCTTTCCGCCCCGATTCTCGCCTCTTCTACCGCCGACGACGACGACGAAGACCTCAGCTTCCTCGAGGAACCGGAATCTGGCGACGCCGTGCCCGTCGACCACCCCCACTCTGATGCCGAATTCTCTGAGGCAGAAGATGAGGACTTCGAGAACTACGACGACTTCGATGTTCCTTCCGACTTCGCTCACGGCGAAGATGGGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000648
ATGGCGACTAGAATCACTCTGCCACTCCTACTTCTCTCTCTCCTCCTCTTCTCCCTCCTTTCCGCCCCGATTCTCGCCTCTTCTACCGCCGACGACGACGACGAAGACCTCAGCTTCCTCGAGGAACCGGAATCTGGCGACGCCGTGCCCGTCGACCACCCCCACTCTGATGCCGAATTCTCTGAGGCAGAAGATGAGGACTTCGAGAACTACGACGACTTCGATGTTCCTTCCGACTTCGCTCACGGCGAAGATGGGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782643.1
MATRITLPLLLLSLLLFSLLSAPILASSTADDDDEDLSFLEEPESGDAVPVDHPHSDAEFSEAEDEDFENYDDFDVPSDFAHGEDGDDEVAAFDEKDVVILADRNFSGFIDENKYVMVEFYAPWCGHCKALEPEYAAAATELKAANVKLAKVDATVENELAENYEVQGFPTVYFFVNGEHQTYSGQRTKDAIVTWIKKKTGPGVSNITTTEDAEHILTSEDKVVLAFLESLVGPDSEEFAAASKLDDDVNFYQTANANVA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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