当前解析结果
SmilChr08G001072| 统一新 Gene ID | SmilChr08G001072 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G001072 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G001072 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 8254339 - 8256845 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130998018 |
|---|---|
| GeneID | 130998018 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130998018 |
| 原始查询 | SmilChr08G001072 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998018 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057779439.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 0.80000 | XP_057779439.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057779439.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057779439.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057779439.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:8254341 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B131,B140,C2 |
Chr8:8254342 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 11 | A15,A16,B56,B77,B88,B98,C44,C64,C66,C81,C86 |
Chr8:8254347 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C77,D9 |
Chr8:8254349 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C77,D9 |
Chr8:8254824 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B123,C37 |
Chr8:8254832 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B123,B135,B42,B69,C37 |
Chr8:8254838 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B126 |
Chr8:8254843 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C14 |
Chr8:8254850 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B129,C14 |
Chr8:8254864 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr8:8254895 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D6 |
Chr8:8254908 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B42,B7,C21,C70 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。