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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001075`

染色体: Chr08 坐标: 8273835-8275136 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001075`
名称	SmilChr08G001075
描述	uncharacterized SmilChr08G001075
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	8273835 - 8275136 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998020`
GeneID	`130998020`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998020`
原始查询	`SmilChr08G001075`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peptide upstream protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824508]; symbol=AT3G53400; hit=AT3G53400; species=arabidopsis; confidence=low
产物	peptide upstream protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824508]; symbol=AT3G53400; hit=AT3G53400; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G53400` (AT3G53400) peptide upstream protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824508] identity=33.3; qcov=1.1; evalue=5.99e-80; confidence=low
Rice	`Os07g0692401` - identity=26.2; qcov=0.942; evalue=1.55e-26; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF25276 (DUF7870)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998020

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057779441.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057779441.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779441.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779441.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779441.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:8273951`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr8:8274074`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr8:8274122`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,B139
`Chr8:8274364`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr8:8274404`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B55,C2
`Chr8:8274459`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr8:8274570`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr8:8274571`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,C21
`Chr8:8274585`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B55,C2
`Chr8:8274665`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr8:8274875`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr8:8275050`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779441.1

433 aa

216

433

DUF7870

PF25276 DUF7870 346-430 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779441.1`	Pfam	`PF25276`	DUF7870	Domain	346	430	1.5e-12	48.7	Domain of unknown function (DUF7870)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923458.1
ATGTACTGGAACAAGTTATTGAAATGGCACGTTCTTCGTGGACCGTTGGTGAGGCGTGTGGTGTTGACAGCCTTTGTGCTCGTCTTGCTTCTAATCCTGCTCTGTGTGCTGCAAATGGGCCGCGAGGTTCGCGTAATCTCAAATGGCGACGGATGCAACCTCGCCGGACTCCCCCTCTTCGGAGCTTCTCCGGCGCCGTCGTCGTGCGAGGAGAGAGAGAACTTGACCAAATCCGCTTTCCAAGAGCTGATGGCGAACAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998020
ATGTACTGGAACAAGTTATTGAAATGGCACGTTCTTCGTGGACCGTTGGTGAGGCGTGTGGTGTTGACAGCCTTTGTGCTCGTCTTGCTTCTAATCCTGCTCTGTGTGCTGCAAATGGGCCGCGAGGTTCGCGTAATCTCAAATGGCGACGGATGCAACCTCGCCGGACTCCCCCTCTTCGGAGCTTCTCCGGCGCCGTCGTCGTGCGAGGAGAGAGAGAACTTGACCAAATCCGCTTTCCAAGAGCTGATGGCGAACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779441.1
MYWNKLLKWHVLRGPLVRRVVLTAFVLVLLLILLCVLQMGREVRVISNGDGCNLAGLPLFGASPAPSSCEERENLTKSAFQELMANNFLQSDATVLCVGERSAAAALALRHLGFFNAFAAERRPLFSLLKRRFAYVLDFADHRFDFVFSEDLDRILVLEMERVLRPGGTGSVLIARGAHSAAALLKSSDVVRVFGVGASTMVVFKKRLDSSFASFDHFQLPTTCPCVENNKPFMNHIEPLTGRNSGKIAYLPDSMNISSR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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