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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001077`

染色体: Chr08 坐标: 8287658-8289051 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001077`
名称	SmilChr08G001077
描述	uncharacterized SmilChr08G001077
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	8287658 - 8289051 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000659`
GeneID	`131000659`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000659`
原始查询	`SmilChr08G001077`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Late embryosis abundant (LEA) protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836173]; symbol=AT5G60520; hit=AT5G60520; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Late embryosis abundant (LEA) protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836173]; symbol=AT5G60520; hit=AT5G60520; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G60520` (AT5G60520) Late embryosis abundant (LEA) protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836173] identity=69.5; qcov=0.894; evalue=1.05e-160; confidence=high
Rice	`Os05g0552600` - identity=42.4; qcov=0.833; evalue=1.89e-69; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF06830 (Root_cap)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000659

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057782665.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057782665.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782665.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782665.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782665.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:8288034`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr8:8288205`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B41,D3
`Chr8:8288255`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,C77
`Chr8:8288337`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr8:8288355`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr8:8288716`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr8:8288743`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr8:8288776`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,C21
`Chr8:8288922`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B108,B41,C39,D3
`Chr8:8288947`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A11
`Chr8:8288947`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782665.1

348 aa

174

348

Root_cap

PF06830 Root_cap 276-332 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782665.1`	Pfam	`PF06830`	Root_cap	Family	276	332	1.3e-25	90.0	Root cap

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926682.1
AACCTATAAATGCTTCCACTAATCTCACCATCAATTTCACAAAATCCAAAGCTCTTAATTAGTAGTTGAAAAATGGAGGCGAGGAAGCTCTACTTTCCGGCGGCTCTCCTCCTCCTCCTTTTCGTCTGGGGCGGCGCCGCCCAAGGCAACAGCAACAAGCAGAAGAAGCCTCCTTACGACGCGGCGACGACCAACTACGAAATGCTGTCAGCGCTGCCGAAGAGCGGGCAGGAGCGAGCCTTCTGCCATGCAAGAGGGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000659
ATGGAGGCGAGGAAGCTCTACTTTCCGGCGGCTCTCCTCCTCCTCCTTTTCGTCTGGGGCGGCGCCGCCCAAGGCAACAGCAACAAGCAGAAGAAGCCTCCTTACGACGCGGCGACGACCAACTACGAAATGCTGTCAGCGCTGCCGAAGAGCGGGCAGGAGCGAGCCTTCTGCCATGCAAGAGGGAAGTGCCACTACAAGACGCTCACCTGCCCGCCCGAGTGCCCCGAGAGGAAGCCCAAGAAGAACAAGAAGCACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782665.1
MEARKLYFPAALLLLLFVWGGAAQGNSNKQKKPPYDAATTNYEMLSALPKSGQERAFCHARGKCHYKTLTCPPECPERKPKKNKKHKGCFVDCSSKCEITCKWRRPKCNGYGALCYDPRFVGGDGVMFYFHGSKGSDFAIVSDHNLHINAHLIGARPPGRTRDYTWVQALALMFDTHTLLIAARKVARWDDRADALAVKWDGQSVAVPTEGEVEWRSSGAGREVVVERTDDVNTVRVTVAGLVEIDVRVTPIGAEENRVH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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