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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001080`

染色体: Chr08 坐标: 8314676-8316425 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001080`
名称	SmilChr08G001080
描述	uncharacterized SmilChr08G001080
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	8314676 - 8316425 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000662`
GeneID	`131000662`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000662`
原始查询	`SmilChr08G001080`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Late embryosis abundant (LEA) protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836173]; symbol=AT5G60520; hit=AT5G60520; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Late embryosis abundant (LEA) protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836173]; symbol=AT5G60520; hit=AT5G60520; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G60520` (AT5G60520) Late embryosis abundant (LEA) protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836173] identity=65.7; qcov=0.64; evalue=2.27e-143; confidence=high
Rice	`Os01g0968300` - identity=40.1; qcov=0.554; evalue=1.55e-65; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF06830 (Root_cap)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000662

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.80000	`XP_057782667.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057782667.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782667.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782667.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782667.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:8314955`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	D6
`Chr8:8314955`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	D6
`Chr8:8314988`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	21	A24,A5,B1,B121,B133,B16,B19,B27,B50,B61,B69,B97,C54,C57,C64,C66,C74,C77,C78,D3,D5
`Chr8:8315047`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D6
`Chr8:8315047`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D6
`Chr8:8315157`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr8:8315160`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr8:8315252`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B61
`Chr8:8315253`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C17,C30,D1
`Chr8:8315255`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B76,B78
`Chr8:8315275`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B78
`Chr8:8315275`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782667.1

464 aa

232

464

Root_cap

PF06830 Root_cap 400-456 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782667.1`	Pfam	`PF06830`	Root_cap	Family	400	456	8.9e-27	93.7	Root cap

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926684.1
TAGACAAAAAAATATTGAGTCTAATTGAATCGGAAAAAATGAAGGCTAGGAGGGTGTGCATATTGGCCGCCCTTGTGGTGCTGTTTGTGGGCAGCATTGTTGCCCAAGCTGATAGCAATGGCAACGGCAATGGATATGGAGAGGAAGATGGAAACAATGGCAACGCCAATGGCAATGGCAACTTGGGGCCGAACAACGGCAACGGCAATGGCAATGGCAACGGGGATGGCAATAATGGAAATGGCAACGGCAATGGCAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000662
ATGAAGGCTAGGAGGGTGTGCATATTGGCCGCCCTTGTGGTGCTGTTTGTGGGCAGCATTGTTGCCCAAGCTGATAGCAATGGCAACGGCAATGGATATGGAGAGGAAGATGGAAACAATGGCAACGCCAATGGCAATGGCAACTTGGGGCCGAACAACGGCAACGGCAATGGCAATGGCAACGGGGATGGCAATAATGGAAATGGCAACGGCAATGGCAACTTGGGAGGCAACAACGGCAACGGCAACGGAAATGGGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782667.1
MKARRVCILAALVVLFVGSIVAQADSNGNGNGYGEEDGNNGNANGNGNLGPNNGNGNGNGNGDGNNGNGNGNGNLGGNNGNGNGNGNAGGNNGNGNGNGNLGGGNGNGNGNGNGNGNGNGNDQGGDENDGDWQGGDDEEDNGQKARRPSPPPPPPARVIPSGNYESLSAVPNSGQERGKCLGAGACQYKTLTCPSDCPERKPKKNRKQKGCFLDCSSRCQATCKWRKPDCNEKGSVCYDPRFVGGDGVMFYFHGSKGNDF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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