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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001084`

染色体: Chr08 坐标: 8355099-8357391 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001084`
名称	SmilChr08G001084
描述	zinc finger protein BALDIBIS-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	8355099 - 8357391 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000666`
GeneID	`131000666`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000666`
原始查询	`SmilChr08G001084`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger protein BALDIBIS-like
产物	zinc finger protein BALDIBIS-like
Arabidopsis	`AT3G50700` (IDD2) indeterminate(ID)-domain 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824234] identity=48.8; qcov=1.04; evalue=3.73e-117; confidence=high
Rice	`Os01g0242200` (OsIDD8) - identity=54.6; qcov=0.751; evalue=4.06e-111; confidence=high
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus)
KEGG	-
Pfam	PF22992 (C2CH-4th_BIRD-IDD); PF22995 (C2CH-3rd_BIRD-IDD); PF22996 (C2H2-2nd_BIRD-IDD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000666

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782672.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782672.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782672.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782672.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057782672.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:8355517`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B34,B9,C10,D8
`Chr8:8355532`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B30,B70
`Chr8:8355581`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B36,B68,C74
`Chr8:8355698`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B16,B93,C13,C29,C43
`Chr8:8356356`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62
`Chr8:8356452`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B55,C2,C21,C36
`Chr8:8356473`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:8356836`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782672.1

422 aa

211

422

C2H2-2nd_BIRD-IDD

C2CH-3rd_BIRD-IDD

C2CH-4th_BIRD-IDD

PF22996 C2H2-2nd_BIRD-IDD 102-136 aa PF22995 C2CH-3rd_BIRD-IDD 140-164 aa PF22992 C2CH-4th_BIRD-IDD 167-205 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782672.1`	Pfam	`PF22996`	C2H2-2nd_BIRD-IDD	Family	102	136	2.4e-20	73.0	BIRD-IDD transcription factor, second C2H2 zinc finger
`XP_057782672.1`	Pfam	`PF22995`	C2CH-3rd_BIRD-IDD	Domain	140	164	8.7e-15	54.8	BIRD-IDD transcription factor, third C2HC zinc finger
`XP_057782672.1`	Pfam	`PF22992`	C2CH-4th_BIRD-IDD	Domain	167	205	1.8e-24	86.0	BIRD-IDD transcription factor, fourth C2HC zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926689.1
GTGATTCTCATTTCCCATGGAATGTTTGCATCTTCTGCGTTGATCATTATTATATAATTTGATATATACTGCAATTAATAAAAGTTACTCCCCTCATCAGACAATGAATACGTACACATGTACATTATATATATATATTTATAGAGAGAGAGAGAGAGGAGTGGTCCAATCTGAGTCTATGGCTGACCGACTTTAGAAGAAGCAGCAGGCAGCAGTAGCAGCCGTGTAAGATAAGGAGAGAGAAAGAGAGAAGAAAATAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000666
ATGATGTCTGAAGATGGGATTCATCCTTCCATGAGAAGCTTCATCCAGGATCCGAATCCCAATCCCAACCCTAATATGAACCCAAACCCTAATCCGAATTCATCGAAGCGCAAGAGAAATCTCCCAGGAACACCAGATCCAGATGCGGAAGTGGTAGCGCTGTCTCCGAAATCTCTAATGGCGACCAACAGATTCCTGTGCGAAATCTGCAACAAGGGTTTCCAGCGAGACCAGAATCTGCAGCTCCACCGCAGGGGACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782672.1
MMSEDGIHPSMRSFIQDPNPNPNPNMNPNPNPNSSKRKRNLPGTPDPDAEVVALSPKSLMATNRFLCEICNKGFQRDQNLQLHRRGHNLPWKLKQRSNKEVKKKVYICPEKSCVHHEASRALGDLTGIKKHYSRKHGEKKWKCEKCSKKYAVQSDWKAHSKICGTREYKCDCGTLFSRKDSFITHRAFCDALAEESARFSSPVASANLNFRNELINTLQTSGNPQFPMLGNLDNMQKPRLPLWLDSANPHLPTANSNNFT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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