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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001108`

染色体: Chr08 坐标: 8595239-8596898 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001108`
名称	SmilChr08G001108
描述	adenylate kinase isoenzyme 6 homolog
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	8595239 - 8596898 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000690`
GeneID	`131000690`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000690`
原始查询	`SmilChr08G001108`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	adenylate kinase isoenzyme 6 homolog
产物	adenylate kinase isoenzyme 6 homolog
Arabidopsis	`AT5G60340` (AAK6) P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836156] identity=67; qcov=0.978; evalue=2e-89; confidence=high
Rice	`Os07g0412400` (P0710F09.137) - identity=72.2; qcov=0.978; evalue=2.25e-87; confidence=high
GO	GO:0004017 (AMP kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity)
KEGG	smil00230 (Purine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01232 (Nucleotide metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03008 (Ribosome biogenesis in eukaryotes - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00004 (AAA); PF04851 (ResIII); PF13207 (AAA_17); PF13238 (AAA_18)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000690

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782701.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057782701.1`
3	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057782701.1`
4	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057782701.1`
5	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057782701.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:8595591`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr8:8596558`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A6
`Chr8:8596558`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782701.1

180 aa

180

ResIII

AAA

AAA_18

AAA_17

PF04851 ResIII 11-72 aa PF00004 AAA 16-50 aa PF13238 AAA_18 16-136 aa PF13207 AAA_17 19-120 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782701.1`	Pfam	`PF04851`	ResIII	Family	11	72	2.4e-05	25.0	Type III restriction enzyme, res subunit
`XP_057782701.1`	Pfam	`PF00004`	AAA	Domain	16	50	3.6e-05	24.9	ATPase family associated with various cellular activities (AAA)
`XP_057782701.1`	Pfam	`PF13238`	AAA_18	Domain	16	136	2.3e-36	125.8	AAA domain
`XP_057782701.1`	Pfam	`PF13207`	AAA_17	Domain	19	120	5.2e-09	37.2	AAA domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926718.1
GTTTATTCAAATATGGAGAGAGAGAAGAAGCGTGTGAGTATGGAGTCGCTACTGTAAGCTGTAAAACGCGAACTCAAACATAAAGCGAAAAACCTCAATTTCCTGTAAACCCTCAATTCATCATCCCACCAGCAGCCGAGGTGTTGTGGAAACAAATCCTGAATCTCGACCTCCAACACAAGCACAAATGGCGCAGAATGGCGGCGGGAGGACGAAGCGAGAGAGGCCAAACATACTTATAACTGGCACGCCGGGGACAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000690
ATGGCGCAGAATGGCGGCGGGAGGACGAAGCGAGAGAGGCCAAACATACTTATAACTGGCACGCCGGGGACAGGCAAAACGACGACGTCCGCGGCCCTGGCGGAGGCCGCCAATCTCCGCCACATCAACGTAGGTGATTTGGTGAAGGAGAAGAGTCTCCACGACGGCTGGGACGACGAGTTCGACTGTTATGTCATCAACGAAGACCTCGTATGCGATGAGCTTGAAGATGTGATGGAACAAGGTGGAAACATTGTAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782701.1
MAQNGGGRTKRERPNILITGTPGTGKTTTSAALAEAANLRHINVGDLVKEKSLHDGWDDEFDCYVINEDLVCDELEDVMEQGGNIVDHHGCDFFPERWFDHVVVLQTDNSVLYDRLAKRGYTGKKLSNNVECEIFQVMLEEAKDSYPENIVVALRSDCVEDIDRNISTLTDWVTNWSSLP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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