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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001114`

染色体: Chr08 坐标: 8655510-8657413 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001114`
名称	SmilChr08G001114
描述	tRNA-splicing endonuclease subunit Sen2-2-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	8655510 - 8657413 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000698`
GeneID	`131000698`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000698`
原始查询	`SmilChr08G001114`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tRNA-splicing endonuclease subunit Sen2-2-like
产物	tRNA-splicing endonuclease subunit Sen2-2-like
Arabidopsis	`AT5G60230` (SEN2) splicing endonuclease 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836145] identity=58.4; qcov=1.01; evalue=3.99e-99; confidence=high
Rice	`Os11g0602400` - identity=48.1; qcov=1.01; evalue=2.19e-71; confidence=high
GO	GO:0000213 (tRNA-intron lyase activity); GO:0000214 (tRNA-intron endonuclease complex); GO:0000379 (tRNA-type intron splice site recognition and cleavage); GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0006388 (tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation)
KEGG	-
Pfam	PF01974 (tRNA_int_endo); PF02778 (tRNA_int_endo_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000698

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782709.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057782709.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057782709.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057782709.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782709.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:8656553`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B68
`Chr8:8656575`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr8:8656899`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,B8
`Chr8:8656941`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,B46,C14,C51
`Chr8:8656960`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr8:8657069`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C47
`Chr8:8657069`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C47
`Chr8:8657131`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B123,B34,C59,C65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782709.1

241 aa

120

241

tRNA_int_endo_N

tRNA_int_endo

PF02778 tRNA_int_endo_N 36-108 aa PF01974 tRNA_int_endo 120-205 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782709.1`	Pfam	`PF02778`	tRNA_int_endo_N	Domain	36	108	7.7e-12	45.3	tRNA intron endonuclease, N-terminal domain
`XP_057782709.1`	Pfam	`PF01974`	tRNA_int_endo	Domain	120	205	2.6e-16	60.2	tRNA intron endonuclease, catalytic C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926726.1
GCCCCAAAATTGAGCCCATTTCTTTATCTTCACGCGCGCGCGCGCACACACACACACCGTCGCACACCTACGCCGCCTCCCCCCCCACTTCTTCCTCGGCGGCAGCGGCCGCCCTCTTCCTCTTGATTCCGGCGAAGATCAGCTCGCTGAACCACCATCATCATAACCGACATCTCACTCTGTTCTGTCTCCATCTCTCGTTCGACACCCTAGATCCCCAAATCTGCCGCCGCTGCCTCCCTTTCCGGCGACGGCGCCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000698
ATGGCCCCGAGATGGAAAGGGAAAGCAGCCGAAGCAAAAGCTCTAGCAGAGCCAATGTCGGTAGTAGTCTCGCAGCTTCAATCCTCTCTGCTCGAATCTGATTCTCAAGGACTGCTTTCCGGGTGTGCCGTGCTTCTGGAAGCTCTCCCACACCAAACTGAACTACTAAACCGAGCTTGTTTTGGGCGCCCTGTTATAACCGCGGACAAGGATAAGCAGTGGCACCAACTAAGTTTCGAAGAAGCTCTCTACTTGTGCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782709.1
MAPRWKGKAAEAKALAEPMSVVVSQLQSSLLESDSQGLLSGCAVLLEALPHQTELLNRACFGRPVITADKDKQWHQLSFEEALYLCFVLKCIKVVGENKCAKNDQELWRYMTAKRVGFPILFKAYSHLRRKNWVVRAGVQYGVDFVAYRYHPALVHSEYAVLALSDEDADANTRLKAWSDFHCTLRLCGSVAKTLLVLHISKNGNDAVSLSSLEHYSVEERIVTRWNPEVSRENQTMIVKK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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