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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001115`

染色体: Chr08 坐标: 8658318-8661960 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001115`
名称	SmilChr08G001115
描述	tetraspanin-3-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	8658318 - 8661960 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000697`
GeneID	`131000697`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000697`
原始查询	`SmilChr08G001115`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tetraspanin-3-like
产物	tetraspanin-3-like
Arabidopsis	`AT3G45600` (TET3) tetraspanin3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823702] identity=70.7; qcov=1; evalue=2.24e-151; confidence=high
Rice	`Os05g0122800` (OsTET7) - identity=61.7; qcov=1.03; evalue=2.13e-123; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0009506 (plasmodesma); GO:0009734 (auxin-activated signaling pathway)
KEGG	-
Pfam	PF00335 (Tetraspanin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000697

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057782707.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782707.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782707.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782707.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782707.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:8658480`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B123,B34,C65
`Chr8:8658519`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B134,C12,C79
`Chr8:8658553`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B119,B26,B85
`Chr8:8658644`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr8:8658671`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,C78
`Chr8:8658692`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr8:8661319`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr8:8661337`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr8:8661422`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr8:8661431`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B38
`Chr8:8661431`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B38
`Chr8:8661604`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782707.1

287 aa

144

287

Tetraspanin

PF00335 Tetraspanin 5-258 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782707.1`	Pfam	`PF00335`	Tetraspanin	Family	5	258	3.8e-36	125.6	Tetraspanin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926724.1
TTGAATTTTTTTTCCACATAAAGCTTCCAAAAACACCAACGAAAATACAAAGAACAGAAAGAAGATGGCAACATCTTGAGAAGGGGCAATAAAGTCAATTACACCAAAATCAATCACAACCTCGCTTACAATTCACAAATCACAATAAAAATATCCACTCCAATTTCCTAAATCCAATAATTTCTCCAAACCCCATTACGCCATTTATTGACAGCTTCATTCATTACAAAAGGAAGAATTTAATTTTTTAAAAAGAGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000697
ATGAGAACGAGCAACCACCTAATCGGGTTCCTGAACTTCCTGACGTTCCTGCTGTCAATCCCGATTCTGGGCGGAGGCATCTGGCTGAGCACCCGCGCCAACAACACCGACTGCGTGAAGTTCCTGCAGTGGCCCATCATCATCATCGGCGTCGCCATCATGGTGGTCTCGCTCGCGGGTTTCGCCGGCTCCTGCTACCGCAACAACTTCCTCATGTACCTCTACCTCTGGGCCATGTTCTTCATCATCGCCGCCCTCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782707.1
MRTSNHLIGFLNFLTFLLSIPILGGGIWLSTRANNTDCVKFLQWPIIIIGVAIMVVSLAGFAGSCYRNNFLMYLYLWAMFFIIAALIGFIVFAYAVTGKGSGQPVMNRAYLDYSLHDYSGTWLADRVTSRSYWSNIRSCIRDSHVCGKMARNVNGVPETADNFYRRKLSPIQSGCCKPPTSCGYVYMNETYWAPGAGLMGTDPDCLRWNYNDQEQLCYDCDSCKAGVLASLKKSWRKVSVINIVILIILVIVYCVACAAF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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