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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001118`

染色体: Chr08 坐标: 8688279-8688997 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001118`
名称	SmilChr08G001118
描述	uncharacterized SmilChr08G001118
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	8688279 - 8688997 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998028`
GeneID	`130998028`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998028`
原始查询	`SmilChr08G001118`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G25270` (AT3G25270) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822121] identity=32.9; qcov=0.617; evalue=2.28e-10; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=30.4; qcov=0.829; evalue=2.61e-17; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998028

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057779448.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057779448.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057779448.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779448.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779448.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:8688335`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr8:8688378`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,C51
`Chr8:8688431`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B112,B88,C10,D8
`Chr8:8688432`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B133,C3,C87
`Chr8:8688449`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr8:8688458`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B84
`Chr8:8688468`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr8:8688485`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,C51
`Chr8:8688490`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	B11,B136,B139,B15,B77,B93,C13,C30,C86
`Chr8:8688508`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	16	A1,A7,B100,B131,B30,B31,B55,B56,B82,B91,C13,C44,C46,C62,C83,D10
`Chr8:8688584`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B112,B88,C10,C17
`Chr8:8688584`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B112,B88,C10,C17

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779448.1

222 aa

111

222

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 53-147 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779448.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	53	147	1.2e-20	74.6	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923465.1
ATGAAGCTTAGCTCAAGTGGCAAAATTGAGTGGAACAAGGAGTTGAGGGAGAGAGAAGAGGAGGCAGCCAGACAACTAACTGATGTTATTTCGTCTTTTGTTCCGGTTGCAGGAATTAAAGATAGCTGGATTTGGGAAGCTGCCAAGGATGGAAGATACTCCATTAAATCAGCGTACGAAGTGATTAAAAATCAGCGGAGTGACAGAGGTGCCCTCCGGCTTGACCTGGAAACTCTGGCGTCGATTTGGGATACGCCTAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998028
ATGAAGCTTAGCTCAAGTGGCAAAATTGAGTGGAACAAGGAGTTGAGGGAGAGAGAAGAGGAGGCAGCCAGACAACTAACTGATGTTATTTCGTCTTTTGTTCCGGTTGCAGGAATTAAAGATAGCTGGATTTGGGAAGCTGCCAAGGATGGAAGATACTCCATTAAATCAGCGTACGAAGTGATTAAAAATCAGCGGAGTGACAGAGGTGCCCTCCGGCTTGACCTGGAAACTCTGGCGTCGATTTGGGATACGCCTAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779448.1
MKLSSSGKIEWNKELREREEEAARQLTDVISSFVPVAGIKDSWIWEAAKDGRYSIKSAYEVIKNQRSDRGALRLDLETLASIWDTPTPQKAIVTGWRLLRNRLPTCDNLRKRKINLGEEDLRCCLCQDHEEDANHLFISCPKTQELWDEIQRWTGISTARPSAAAAHWLSFSECGQNKKGRKLLNAIWLSCCWLLWKRRNEIRFEGKTWEVYNLLVEIKVRG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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