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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001121`

染色体: Chr08 坐标: 8724537-8733411 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001121`
名称	SmilChr08G001121
描述	V-type proton ATPase subunit a1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	8724537 - 8733411 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000703`
GeneID	`131000703`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000703`
原始查询	`SmilChr08G001121`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	V-type proton ATPase subunit a1-like
产物	V-type proton ATPase subunit a1-like
Arabidopsis	`AT2G28520` (VHA-A1) vacuolar proton ATPase A1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817400] identity=74.8; qcov=0.993; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0834200` (P0460C04.33-1) - identity=72.3; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000220 (vacuolar proton-transporting V-type ATPase, V0 domain); GO:0007035 (vacuolar acidification); GO:0016471 (vacuolar proton-transporting V-type ATPase complex); GO:0046961 (proton-transporting ATPase activity, rotational mechanism); GO:0051117 (ATPase binding); GO:1902600 (proton transmembrane transport)
KEGG	smil00190 (Oxidative phosphorylation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04145 (Phagocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01496 (V_ATPase_I)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000703

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057782720.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	0.80000	`XP_057782720.1`
3	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.40000	`XP_057782720.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057782720.1`
5	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057782720.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:8724978`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,B118
`Chr8:8725021`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,C78
`Chr8:8726310`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B23,B35,C77
`Chr8:8726555`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B23,B35,C77
`Chr8:8727345`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,C46
`Chr8:8727613`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B74,B88,C73
`Chr8:8727884`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,B35
`Chr8:8729361`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B109,B114,B120,B22,C41
`Chr8:8730073`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B61
`Chr8:8731403`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B109,B114,B120,B22,C41
`Chr8:8731632`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5
`Chr8:8732907`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782720.1

819 aa

410

819

V_ATPase_I

PF01496 V_ATPase_I 36-811 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782720.1`	Pfam	`PF01496`	V_ATPase_I	Family	36	811	1.9e-297	989.4	V-type ATPase 116kDa subunit family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009093771.1
TTTACCAATAAAAACCCCAAAAGCGACCAGAAACCAAGCTGTTGCAGTTTCCACCGCCGCTGCTTACTTACTTGCTACTAAGCGCGCATACACAATAAAAATCAACTGACATCTATTCACCGACACCCGCATTCCCCATATTTCTCGCACTAAACCTCTCCATCTCTCTCTCACATACACACGCTACTAAACCTCTTCAACACCTCTCTCACACAAATGCACTTGTTAGTTGGTTTGATCGGACATCTGAAGCAGAGGAG...

XM_057926737.1
CTGGACCGCGTGACCTTGGATTTTTCTTGGCTTAAACTCTTCTCCACCGTTTTACCAATAAAAACCCCAAAAGCGACCAGAAACCAAGCTGTTGCAGTTTCCACCGCCGCTGCTTACTTACTTGCTACTAAGCGCGCATACACAATAAAAATCAACTGACATCTATTCACCGACACCCGCATTCCCCATATTTCTCGCACTAAACCTCTCCATCTCTCTCTCACATACACACGCTACTAAACCTCTTCAACACCTCTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000703
ATGGAGTACATCGACAATTTGCCAAGCATGGATCTAATGCGCTCCGAGAAGATGATGTTCGTGCAACTCATTATCCCCGTCGAGTCGGCTCACCGCGCTCTCTCTTATCTCGGCCAGCTCGGTCTCATGCAATTCCGCGACTTAAATGATGATAAAAGCCCTTTCCAGAGAACATTTGTTAATCAGGTTAAAAGGTGTGCTGAGATGTCTCGGAAACTACGATTTATCAAAGATCAGATACATAAAGCTTGTTTGACACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782720.1
MEYIDNLPSMDLMRSEKMMFVQLIIPVESAHRALSYLGQLGLMQFRDLNDDKSPFQRTFVNQVKRCAEMSRKLRFIKDQIHKACLTPSSNSSSQSDIELEELEIQLAEHEHGLSEMNANSEKLQRTYNELLEFKMVLQKAGDFLLSSGSHMTAEETELNDNVHISDNYADTSSLLDQEMQNGPSTQSGVRFVSGIIPKSKALRFERMLFRTTRGNMLFNQAPAFDQILDPATNEMVEKTVFVVSFSGEQVRIKILKICEA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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