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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001123`

染色体: Chr08 坐标: 8737008-8739210 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001123`
名称	SmilChr08G001123
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 2.7-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	8737008 - 8739210 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000705`
GeneID	`131000705`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000705`
原始查询	`SmilChr08G001123`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 2.7-like
产物	protein NRT1/ PTR FAMILY 2.7-like
Arabidopsis	`AT3G45650` (NAXT1) nitrate excretion transporter1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823707] identity=50.8; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0687000` (OsNPF2.4) - identity=39; qcov=1.01; evalue=2.08e-116; confidence=medium
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006857 (oligopeptide transport); GO:0022857 (transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00854 (PTR2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000705

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057782723.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057782723.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057782723.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782723.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782723.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:8737118`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr8:8737305`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr8:8737410`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr8:8737415`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:8737536`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr8:8737577`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,C19,C50,C75,C83
`Chr8:8737664`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr8:8737674`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B36,C65,D6
`Chr8:8737966`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,B1
`Chr8:8738110`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B41,C82,C85
`Chr8:8738377`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B45,C32,C68
`Chr8:8738591`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C32

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782723.1

538 aa

269

538

PTR2

PF00854 PTR2 92-486 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782723.1`	Pfam	`PF00854`	PTR2	Family	92	486	1.2e-61	209.5	POT family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926740.1
AATCATTGACCTTGCCGTAATGATTGTTCAAACAAGTTGAGTTTTTTAGGCACGATAAAGCTGACTTTGCTAGTTGGGGATGTAATCCTTCCAAGAAAGAACAAAAAATGGTGGTGGTTGTGCCGTAACTAAGTATAAAAGATTAGGTTTCTCAAAAAAAAAGTATAAAATATTAGGACGCCAAGAATTTCTTGTACAGATAAACTCAATAAATCAGTTAGTTTTGAGTTGTGAGCATACACAGGTTGAGAAAAATGAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000705
ATGAGAGACAAGTCAGCAGGTTCCATGGATGAAGCAGCTCGTTTATCGCGTAAAGGCAGGCGTGGAGGCTGGATCACCTTCCCCTTCATCATAGGGACAATGGGGTGCTTAGCTCTTGCAGCCGGAGGCTGGACGGCTAACCTTATCGTCTATTTGATTCAAGAATTCAACATTAAGAGCATAAGTTCTGCTAAGATTTACAACTTTGTGAATGGAAGCATCACCCTCTTCCCTATTGTTGGTGCAGTCATAGCTGACTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782723.1
MRDKSAGSMDEAARLSRKGRRGGWITFPFIIGTMGCLALAAGGWTANLIVYLIQEFNIKSISSAKIYNFVNGSITLFPIVGAVIADSFLGCYSVICFSSLISLLGTLVLVLTAVVDRLRPPACEDGSNLCKYPSHLQFGVLYIGLALASLGNAGTRFTIATMGADQFDSPKHRGIFFNWYIFTMYTATIVSSTAIVYVEDNLSWTWGFTICAVANVLGLALLLSGRRSYRLMKPQGSPFTSLVRVAVAALSKRKMTLSDK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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