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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001128`

染色体: Chr08 坐标: 8815756-8817858 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001128`
名称	SmilChr08G001128
描述	uncharacterized SmilChr08G001128
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	8815756 - 8817858 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998029`
GeneID	`130998029`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998029`
原始查询	`SmilChr08G001128`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0125300; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os08g0125300; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT4G05360` (AT4G05360) Zinc knuckle (CCHC-type) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825884] identity=29; qcov=0.266; evalue=1.08e-11; confidence=weak
Rice	`Os08g0125300` - identity=21.9; qcov=0.47; evalue=5.26e-19; confidence=weak
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF14223 (Retrotran_gag_2); PF22936 (Pol_BBD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998029

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057779449.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057779449.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779449.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779449.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779449.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:8815771`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,C53,C72
`Chr8:8815786`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B50,C69,D3,D9
`Chr8:8815793`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B62,C34
`Chr8:8815801`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B72
`Chr8:8815812`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr8:8815819`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr8:8815834`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A18,B66,C17
`Chr8:8815834`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B66,C17
`Chr8:8815841`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr8:8815844`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B42,B87,C41,C83
`Chr8:8815848`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B65,C35,C45,C63
`Chr8:8815856`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B32,C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779449.1

700 aa

350

700

Retrotran_gag_2

Pol_BBD

PF14223 Retrotran_gag_2 57-214 aa PF22936 Pol_BBD 621-664 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779449.1`	Pfam	`PF14223`	Retrotran_gag_2	Domain	57	214	2.1e-24	86.9	gag-polypeptide of LTR copia-type
`XP_057779449.1`	Pfam	`PF22936`	Pol_BBD	Domain	621	664	3.6e-11	43.9	Pol polyprotein, beta-barrel domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923466.1
ATGGCCTCACAAAAAGAAGGTGGGTCAATTGTCAGACCACCGTTACTGGATGGAACGAATTATGTGTACTGGAAGCATCGAATGGCCTCATTCATTCGAGCGGTGGATGAAAACTCATGGACTTCTGTTGAAGAGGGCTGGACTTCTCCTGTGGATGATGAAGGAAAACAGAAACCTAGAACCAAGTGGACGACCAAAGAATTGGCTGCATCGAATGCAAATCAAAAGGCGCTAAATTCTATTCAGAATGCTGTTTCCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998029
ATGGCCTCACAAAAAGAAGGTGGGTCAATTGTCAGACCACCGTTACTGGATGGAACGAATTATGTGTACTGGAAGCATCGAATGGCCTCATTCATTCGAGCGGTGGATGAAAACTCATGGACTTCTGTTGAAGAGGGCTGGACTTCTCCTGTGGATGATGAAGGAAAACAGAAACCTAGAACCAAGTGGACGACCAAAGAATTGGCTGCATCGAATGCAAATCAAAAGGCGCTAAATTCTATTCAGAATGCTGTTTCCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779449.1
MASQKEGGSIVRPPLLDGTNYVYWKHRMASFIRAVDENSWTSVEEGWTSPVDDEGKQKPRTKWTTKELAASNANQKALNSIQNAVSMEVFTLISMCATAKETWDVLQNTYEGNSKVKKQRLQQLTSRFEELKMDEHETITMFHGKILAIANESFSLGEMIPKERLVRKVMRSLPERFDYKVTAIDEAHDVSDMKLEELIGSLRTFEMNLKSEKSGEKKCIAFAAESRSSKLDMANFDTDDLVKSFALFTKKFGKAFNRFK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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