当前解析结果
SmilChr08G001133| 统一新 Gene ID | SmilChr08G001133 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G001133 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G001133 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 8895419 - 8898029 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131000715 |
|---|---|
| GeneID | 131000715 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131000715 |
| 原始查询 | SmilChr08G001133 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131000715 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 0.80000 | XP_057782744.1 |
| 2 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.60000 | XP_057782742.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057782743.1 |
| 4 | Chloroplast thylakoid | 类囊体 | 0.40000 | XP_057782744.1 |
| 5 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.20000 | XP_057782741.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:8896666 |
T |
TA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | B83 |
Chr8:8896666 |
T |
TA |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | B83 |
Chr8:8896667 |
TGC |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B83 |
Chr8:8896667 |
TGC |
T |
2bp_deletion | CDS_variant | 1 | B83 |
Chr8:8896675 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B140,B24 |
Chr8:8896679 |
G |
GT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 95 | A10,A20,A21,A5,B11,B112,B113,B114,B117,B118,B119,B126,B127,B129,B13,B138,B15,B17,B20,B21,B22,B24,B26,B27,B28,B30,B33,B35,B48,B50,B51,B52,B55,B57,B59,B62,B63,B64,B67,B7,B71,B72,B75,B78,B79,B8,B80,B83,B84,B87,B88,B90,B92,B93,B96,B98,B99,C11,C13,C14,C15,C16,C18,C20,C22,C26,C28,C3,C30,C33,C34,C39,C41,C5,C51,C53,C59,C61,C67,C72,C74,C78,C81,C82,C85,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D4,D5,D9 |
Chr8:8896680 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B140,B24 |
Chr8:8896789 |
CA |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 130 | A10,A11,A13,A16,A18,A20,A21,A25,A5,A8,B102,B108,B11,B111,B112,B113,B114,B117,B118,B119,B120,B121,B124,B125,B126,B129,B130,B132,B138,B139,B15,B17,B20,B21,B24,B25,B26,B27,B28,B3,B30,B33,B35,B36,B37,B44,B45,B48,B51,B52,B55,B57,B59,B61,B62,B64,B67,B7,B71,B72,B73,B75,B78,B79,B8,B80,B83,B84,B86,B87,B88,B9,B90,B91,B92,B98,B99,C11,C13,C14,C15,C16,C18,C20,C22,C24,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C33,C34,C35,C39,C41,C43,C46,C47,C5,C51,C53,C54,C56,C61,C65,C67,C7,C72,C73,C74,C75,C78,C81,C84,C85,C86,C87,C9,D1,D10,D2,D3,D4,D5,D8,D9 |
Chr8:8896852 |
G |
GT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 35 | A18,A25,B102,B108,B11,B111,B114,B132,B15,B20,B24,B27,B30,B37,B44,B51,B62,B64,B75,B83,B90,B93,C11,C26,C27,C3,C33,C5,C51,C61,C72,C74,C78,C81,D9 |
Chr8:8897070 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C72 |
Chr8:8897088 |
T |
TA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | B46 |
Chr8:8897088 |
T |
TA |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | B46 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
4 records
下载 cDNA FASTA4 records
下载 CDS FASTA4 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。