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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001135`

染色体: Chr08 坐标: 8920467-8922436 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001135`
名称	SmilChr08G001135
描述	protein farnesyltransferase subunit beta-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	8920467 - 8922436 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000718`
GeneID	`131000718`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000718`
原始查询	`SmilChr08G001135`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein farnesyltransferase subunit beta-like
产物	protein farnesyltransferase subunit beta-like
Arabidopsis	`AT5G40280` (ERA1) Prenyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834026] identity=79.1; qcov=0.771; evalue=7.59e-47; confidence=medium
Rice	`Os01g0737800` - identity=72.5; qcov=0.771; evalue=4.9e-42; confidence=medium
GO	GO:0004660 (protein farnesyltransferase activity); GO:0005965 (protein farnesyltransferase complex); GO:0018343 (protein farnesylation)
KEGG	-
Pfam	PF00432 (Prenyltrans)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000718

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057782746.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057782746.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057782746.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782746.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782746.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:8920602`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,C55,C70
`Chr8:8920933`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B114,B28,C46
`Chr8:8921520`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B2,C84
`Chr8:8921520`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B2,C84
`Chr8:8921535`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B2
`Chr8:8921535`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B2
`Chr8:8921579`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,D6
`Chr8:8921724`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B68,C32,C68
`Chr8:8921768`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B34,C22,C82
`Chr8:8921921`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,D10
`Chr8:8921947`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C57,D10
`Chr8:8921957`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782746.1

118 aa

118

Prenyltrans

PF00432 Prenyltrans 2-90 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782746.1`	Pfam	`PF00432`	Prenyltrans	Repeat	2	90	3.4e-28	99.6	Prenyltransferase alpha-alpha toroid domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926763.1
TCGATAAATAGAGAAAAGCTGTATGCCTTTTTGCTGCGAATGAAAGATGCAAGCGGTGGCTTCAGGATGCACGATGGTGGAGAAGTAGATGTCCGCGCTTGCTACACTGCAATATCTGTGGCCAGTGTTCTTAACATTTTGGATGATAGGCTGATACAAAATGTAGGAGATTACATCGTAAGTTGCCAGACTTATGAAGGTGGTATTGCTGGTGAACCTGGCTCAGAAGCTCATGGTGGGTACGCATTTTGTGGTTTGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000718
ATGAAAGATGCAAGCGGTGGCTTCAGGATGCACGATGGTGGAGAAGTAGATGTCCGCGCTTGCTACACTGCAATATCTGTGGCCAGTGTTCTTAACATTTTGGATGATAGGCTGATACAAAATGTAGGAGATTACATCGTAAGTTGCCAGACTTATGAAGGTGGTATTGCTGGTGAACCTGGCTCAGAAGCTCATGGTGGGTACGCATTTTGTGGTTTGGCTGCAATGGTTTTGATCAATGAGGCCGATCGTTTGGACTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782746.1
MKDASGGFRMHDGGEVDVRACYTAISVASVLNILDDRLIQNVGDYIVSCQTYEGGIAGEPGSEAHGGYAFCGLAAMVLINEADRLDLPGLLVCGGLNEPYVELKRLVNSQEKLYHMAS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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