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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001146`

染色体: Chr08 坐标: 9039284-9043296 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001146`
名称	SmilChr08G001146
描述	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g05700
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	9039284 - 9043296 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000730`
GeneID	`131000730`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000730`
原始查询	`SmilChr08G001146`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g05700
产物	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g05700
Arabidopsis	`AT1G05700` (AT1G05700) Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837077] identity=32.7; qcov=0.891; evalue=8.52e-60; confidence=low
Rice	`Os05g0525800` (OsRLCK190) - identity=32.6; qcov=0.896; evalue=4.36e-56; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF12819 (Malectin_like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000730

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057782760.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057782760.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782760.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782760.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782760.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:9040684`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B131,B82
`Chr8:9040728`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B138,B15,C1,C61
`Chr8:9041347`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B136,B70,C16,C62
`Chr8:9041407`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C24
`Chr8:9041407`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C24
`Chr8:9041605`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B23,B35,B78
`Chr8:9041653`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr8:9041710`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B134,B47,B68
`Chr8:9041825`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,B65
`Chr8:9041857`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,B65
`Chr8:9041989`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr8:9042061`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,C22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782760.1

624 aa

312

624

Malectin_like

LRR_1

PF12819 Malectin_like 31-343 aa PF00560 LRR_1 422-443 aa PF00560 LRR_1 445-465 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782760.1`	Pfam	`PF12819`	Malectin_like	Domain	31	343	2.7e-59	201.8	Malectin-like domain
`XP_057782760.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	422	443	5e-06	26.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057782760.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	445	465	5e-06	26.3	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926777.1
TTATTGTTTAAATCAAAGAACATTCAACTAAGCTTATCTGTTGAAGTTACTACGCTGATACTGAAACTAATAAAATAATAACGGCAAAACCCAAAATAAAAAGGTAATGCTACTACAGAGAGAAACAACGAGTTAAAACTTCTCTTATAATTGGAACAGTCAAGTATGAACTAAGCTCATTCTTAAAGATTTGATTGGACTACAATTTGCAACGAAACCTACTTACAAGAATTGTATTGAGATTTGTATCCAATCAAGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000730
ATGCACAAGTCAGTAATCCTTTTCGTTGTGGCGACGTTGCTCTTCAACCTCACCCTCTCCGCACAAGGCCAACCAGATTCATGGATAGGAATCGACTGCGGGTCGAACAAAAGCACCGCGACATTCGGTCTCATCTGGGACACAGATGAGGCCTTCATCAAGTCGGGGACGAACCACTTGGTCCCCGACAACACCCTCATCGACCTCGTCACTTTTCAGACTCTCCGCGCCTTCACGGACCAGAACAAGAACTGCTACAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782760.1
MHKSVILFVVATLLFNLTLSAQGQPDSWIGIDCGSNKSTATFGLIWDTDEAFIKSGTNHLVPDNTLIDLVTFQTLRAFTDQNKNCYTLPRSSDNGYFIRAAFLYANYDGQSRPPTFDLEIDGNKWTTVVTTPTDYAFYEILYWTHKPNISVCLATTHKDEFPFISTLEAWPISYDMYTGLSRDLGWLTTYRYAYGSNTEVFGYIGGDDYNRIWEATSVANAVNTSGGSVSYCDENVPSSAIEDAVESPDNATSLWLNFGA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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