当前解析结果
SmilChr08G001148| 统一新 Gene ID | SmilChr08G001148 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G001148 |
| 描述 | single-strand DNA endonuclease 1-like |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 9053507 - 9055769 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131000732 |
|---|---|
| GeneID | 131000732 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131000732 |
| 原始查询 | SmilChr08G001148 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | single-strand DNA endonuclease 1-like |
| 产物 | single-strand DNA endonuclease 1-like |
| Arabidopsis | AT3G48900 (AT3G48900)single-stranded DNA endonuclease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824051] identity=68.2; qcov=0.423; evalue=4.21e-13; confidence=low |
| Rice | Os08g0101600 (OsSEND-1)- identity=37.5; qcov=0.923; evalue=2.35e-11; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131000732 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057782764.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057782764.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057782764.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057782764.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057782764.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:9054079 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D3 |
Chr8:9054730 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A19,C71 |
Chr8:9054832 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B7 |
Chr8:9054837 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B91,C12 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
4 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。