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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001151`

染色体: Chr08 坐标: 9088431-9090343 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001151`
名称	SmilChr08G001151
描述	3-ketoacyl-CoA synthase 12-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	9088431 - 9090343 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000735`
GeneID	`131000735`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000735`
原始查询	`SmilChr08G001151`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	3-ketoacyl-CoA synthase 12-like
产物	3-ketoacyl-CoA synthase 12-like
Arabidopsis	`AT2G28630` (KCS12) 3-ketoacyl-CoA synthase 12 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817412] identity=67.6; qcov=0.972; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0472900` (OSJNBb0094K03.7) - identity=55.3; qcov=0.981; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006633 (fatty acid biosynthetic process); GO:0016020 (membrane); GO:0016747 (acyltransferase activity, transferring groups other than amino-acyl groups)
KEGG	smil00062 (Fatty acid elongation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02797 (Chal_sti_synt_C); PF08392 (FAE1_CUT1_RppA); PF08541 (ACP_syn_III_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000735

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057782769.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057782769.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782769.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782769.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782769.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:9088673`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr8:9088688`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B37,C39,C87
`Chr8:9088857`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	142	A1,A11,A13,A14,A16,A18,A23,A25,A3,A5,A6,A8,A9,B10,B100,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B11,B113,B117,B118,B120,B123,B127,B132,B133,B134,B136,B137,B138,B139,B140,B15,B18,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B27,B28,B3,B30,B35,B36,B37,B39,B42,B43,B44,B46,B47,B49,B5,B54,B55,B56,B58,B59,B6,B62,B63,B64,B68,B71,B72,B74,B75,B76,B78,B81,B85,B86,B87,B88,B89,B9,B95,B96,B97,B98,B99,C11,C13,C14,C15,C18,C21,C22,C23,C24,C28,C3,C30,C31,C32,C34,C36,C37,C39,C40,C42,C43,C46,C47,C48,C50,C51,C53,C54,C57,C58,C6,C61,C63,C64,C65,C67,C68,C69,C7,C72,C78,C79,C81,C82,C84,C85,C87,C9,D1,D10,D2,D3,D7,D8
`Chr8:9088899`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B89,C21
`Chr8:9088899`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B89,C21
`Chr8:9088913`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B17,B65,B92
`Chr8:9088934`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr8:9088947`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B73,C12
`Chr8:9088957`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,C28
`Chr8:9088967`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B12,B51,B55,C39,C60
`Chr8:9088976`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B129,B35,D10
`Chr8:9088981`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B140,C17,C22,C37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782769.1

470 aa

235

470

FAE1_CUT1_RppA

ACP_syn_III_C

Chal_sti_synt_C

PF08392 FAE1_CUT1_RppA 28-315 aa PF08541 ACP_syn_III_C 336-417 aa PF02797 Chal_sti_synt_C 339-411 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782769.1`	Pfam	`PF08392`	FAE1_CUT1_RppA	Family	28	315	2.1e-114	382.5	FAE1/Type III polyketide synthase-like protein
`XP_057782769.1`	Pfam	`PF08541`	ACP_syn_III_C	Domain	336	417	2.2e-17	63.7	3-Oxoacyl-[acyl-carrier-protein (ACP)] synthase III C terminal
`XP_057782769.1`	Pfam	`PF02797`	Chal_sti_synt_C	Domain	339	411	3.2e-08	34.4	Chalcone and stilbene synthases, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926786.1
CCGTGCGCAATTAACTAATTCATGTGGCTTGCTGATTCGTAAATACTAGGGTTTTGTGTATGATATAAATTAGGGAAAGTCACACACAATAACGAGTTGGTGGAAGTTGAGAGATTCAATTAGTGTTTCTAAGTCCAGGGTCACATGTTTCCCCAACTCTTTAATAACACCATATAATCTCCATCCATCAAACCAAAGATCCTAAATAGAAAATAGAAAACACAAAAAATAAAATAAAAACCACACACTATTTATTTCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000735
ATGAATCTTGCTGTCGCCATGTTATTCTACTGCCTCTCTCTCCTCTCTCTACTCTACTTGATATGGAGATTCGTGGACGGCAAGAGGCACCGCAACTGCTACATCCTTGACTACGAGTGCTACAAGCCCACGGACGACCGGCGGCTGAGCACGAAATTCTCCGGCGAGGTGATCCGCCGCAACAAGCACCTGGGCCTCAACGAGTACAAGTTCCTCCTCAAGGCCATCGTCAGCTCCGGCATCGGCGAGGAGACCTACGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782769.1
MNLAVAMLFYCLSLLSLLYLIWRFVDGKRHRNCYILDYECYKPTDDRRLSTKFSGEVIRRNKHLGLNEYKFLLKAIVSSGIGEETYAPKMVFEGREASPCLRDGLLEMDEFFHDSIDKLLQRSGIPPAEIDVLVLNISMLATVPSLSSRIINRYKMREDVKVYNLTGMGCSASLVSVNLVHSIFQTRRNTHALLVTSESLSLGWYTGNDRSMILANCLFRSGGCAMILTNKPYLKEKAMFKLKTLVRTHHGSRDESYDCC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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