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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001173`

染色体: Chr08 坐标: 9379040-9380485 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001173`
名称	SmilChr08G001173
描述	transcription factor MYB59
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	9379040 - 9380485 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000755`
GeneID	`131000755`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000755`
原始查询	`SmilChr08G001173`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor MYB59
产物	transcription factor MYB59
Arabidopsis	`AT3G46130` (MYB48) myb domain protein 48 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823756] identity=51; qcov=1.15; evalue=1.28e-76; confidence=high
Rice	`Os11g0700500` (MYBAS1) - identity=52.2; qcov=1.04; evalue=1.39e-69; confidence=high
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding); PF13921 (Myb_DNA-bind_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000755

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782803.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782803.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782803.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782803.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057782803.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:9379514`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr8:9379543`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,C39
`Chr8:9379603`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,C39
`Chr8:9379638`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	17	A5,B107,B121,B133,B19,B27,B61,B69,B72,C28,C54,C64,C66,C74,C78,D3,D5
`Chr8:9379644`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	74	A15,A2,A20,A25,A5,A6,A7,B100,B104,B109,B117,B123,B127,B131,B2,B21,B22,B24,B27,B29,B35,B36,B38,B39,B45,B48,B5,B52,B53,B54,B56,B58,B59,B62,B67,B7,B70,B71,B73,B75,B78,B80,B94,B95,B96,C10,C16,C18,C22,C27,C29,C34,C4,C40,C42,C48,C49,C50,C51,C54,C57,C60,C61,C62,C70,C72,C74,C76,C77,C84,C9,D11,D8,D9
`Chr8:9379645`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	54	A15,A2,A20,A25,A6,A7,B104,B109,B123,B127,B131,B2,B21,B22,B24,B29,B35,B36,B38,B39,B48,B5,B52,B53,B58,B59,B7,B70,B71,B75,B78,B80,B94,B95,C10,C16,C18,C22,C27,C29,C34,C4,C42,C48,C50,C60,C61,C62,C70,C72,C77,C84,D11,D8
`Chr8:9379913`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B55,C2
`Chr8:9379928`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr8:9380118`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782803.1

214 aa

107

214

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

PF00249 Myb_DNA-binding 11-58 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 14-73 aa PF00249 Myb_DNA-binding 64-108 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 68-115 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782803.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	11	58	1.9e-35	121.4	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057782803.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	14	73	3.9e-20	72.5	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057782803.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	64	108	1.9e-35	121.4	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057782803.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	68	115	3.9e-20	72.5	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926820.1
AAAAAAAGGAGAGAAAATTAAGAAGTGCATGGTATAATAGTTGTGGTTTATGGAATGAAAGCGCAGGTGGACGGCCACTTATGAAAGTTACGTCAACATATCAACCACTTATCTAAAGAAACACCAACGCCACCTTTATAATGCTTTCCATCAACATTGAAATAGCCATCTTCTCCTATCACCCCACCCCACCCCACCCCCATATAATTAATATATATATAGCAGCACCACACACGCCATACATCACAGTCGCCGTGTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000755
ATGATGGAGAAAGAAGATTCGACGATGAGAAAGGGTCCATGGACGGAAGAAGAGGACGCTCAGTTGGTGTTCTACGTGAACTTGTTTGGCGACCGGCGCTGGGACTTCATAGCTAAAGTATCAGGTCTGAAGAGAACCGGCAAGAGCTGCCGCCTCCGCTGGGTCAACTACCTCCACCCGGGCCTCAAGAGGGGCAAAATGACCCCCCACGAGGAGCGTCTCGTTCTCCAACTCCACTCCAAATGGGGAAACAGATGGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782803.1
MMEKEDSTMRKGPWTEEEDAQLVFYVNLFGDRRWDFIAKVSGLKRTGKSCRLRWVNYLHPGLKRGKMTPHEERLVLQLHSKWGNRWSRIARKIPGRTDNEIKNYWRTHMRKKAQDQKKKSIAQSSSSSSSSSSTKGPSFYDTGGDNKSKTGAEEVYSMDEIWKDIELCEESSSFTPLAWDFPTDDSLWAVDEEEPKMLIAHQYDSFPFDNHMTG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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