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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001177`

染色体: Chr08 坐标: 9450195-9454259 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001177`
名称	SmilChr08G001177
描述	ras-related protein RABE1c-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	9450195 - 9454259 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000762`
GeneID	`131000762`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000762`
原始查询	`SmilChr08G001177`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ras-related protein RABE1c-like
产物	ras-related protein RABE1c-like
Arabidopsis	`AT3G46060` (RABE1c) RAB GTPase homolog 8A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823749] identity=89.8; qcov=0.954; evalue=3.57e-136; confidence=high
Rice	`Os05g0461300` (OsRab8A2) - identity=87.9; qcov=0.954; evalue=6.06e-130; confidence=high
GO	GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005525 (GTP binding); GO:0006904 (GO:0006904); GO:0009306 (protein secretion); GO:0017157 (regulation of exocytosis)
KEGG	smil04144 (Endocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00009 (GTP_EFTU); PF00025 (Arf); PF00071 (Ras); PF01926 (MMR_HSR1); PF08477 (Roc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000762

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	1.00000	`XP_057782809.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057782809.1`
3	Trans-golgi network	Trans-golgi network	1.00000	`XP_057782809.1`
4	Vesicle	囊泡	1.00000	`XP_057782809.1`
5	Endosome	内体	1.00000	`XP_057782809.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:9452088`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr8:9452636`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,B53
`Chr8:9453720`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782809.1

216 aa

108

216

Arf

Roc

Ras

MMR_HSR1

GTP_EFTU

PF00025 Arf 16-171 aa PF08477 Roc 17-131 aa PF00071 Ras 17-178 aa PF01926 MMR_HSR1 18-129 aa PF00009 GTP_EFTU 49-173 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782809.1`	Pfam	`PF00025`	Arf	Domain	16	171	8.4e-16	58.7	ADP-ribosylation factor family
`XP_057782809.1`	Pfam	`PF08477`	Roc	Domain	17	131	3.7e-35	121.5	Ras of Complex, Roc, domain of DAPkinase
`XP_057782809.1`	Pfam	`PF00071`	Ras	Domain	17	178	1.2e-68	230.5	Ras family
`XP_057782809.1`	Pfam	`PF01926`	MMR_HSR1	Family	18	129	1.4e-05	25.9	50S ribosome-binding GTPase
`XP_057782809.1`	Pfam	`PF00009`	GTP_EFTU	Domain	49	173	9e-08	32.6	Elongation factor Tu GTP binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926826.1
ATTTTATTTAATTTAATTGGTGAGTTTTGTTAAAAATAAAAAATAAAAAATAATAATTGGTGAGGGTGTTTGCTAGCATGCGCGATGGGGGCACCGCATCTCCTCTAAACAAGGCGCGCAGCATAGCCAACTACGGACGGCGTGTCCGTCTCCCCCTCTTTCTCGAAATAGAATTGTGATCATTTTGGTTTCTATGCAGAGCGGTTAGTAAAATTCGCACTGACAAAAAAAGAAACAACATTCAACGACGCCGTATTGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000762
ATGGCCGCACCACCGGCAAGGGCGCGAGCAGATTACGACTGTCTTATCAAGCTTCTCCTCATCGGCGACAGCGGTGTAGGTAAGAGTTGTCTTCTTTTGCGATTTTCTGATGGTTCCTTCACGACTAGTTTCATTACCACCATTGGAATTGATTTTAAGATAAGAACTGTTGAACTCGATGGCAAACGAATCAAGCTCCAAATCTGGGATACCGCTGGTCAAGAAAGATTCAGAACAATCACTACAGCTTACTACCGTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782809.1
MAAPPARARADYDCLIKLLLIGDSGVGKSCLLLRFSDGSFTTSFITTIGIDFKIRTVELDGKRIKLQIWDTAGQERFRTITTAYYRGAMGILLVYDVTDEASFNNIRNWIRNIEQHASDNVNKILVGNKADMDESKRAVSTAKGQALADEYGIKFFETSAKTNHNVEEVFFSIARDIKQRLSESESKSEQPSTIKMNQPDAAGGGGQAAPKSACCG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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