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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001179`

染色体: Chr08 坐标: 9458028-9463393 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001179`
名称	SmilChr08G001179
描述	protein ALP1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	9458028 - 9463393 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000759`
GeneID	`131000759`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000759`
原始查询	`SmilChr08G001179`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ALP1-like
产物	protein ALP1-like
Arabidopsis	`AT3G55350` (AT3G55350) PIF / Ping-Pong family of plant transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824701] identity=53.65; qcov=0.917; evalue=9.98e-141; confidence=high
Rice	`Os11g0702700` - identity=51.01; qcov=0.894; evalue=1.59e-137; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000759

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782806.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057782806.1`
3	Nuclear body	核内小体	0.40000	`XP_057782806.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:9458280`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:9458336`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:9458372`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B66,B8,D11
`Chr8:9458406`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137
`Chr8:9458407`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B44,B88,B95
`Chr8:9458409`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B31,B53,B66,B92
`Chr8:9458447`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B24,B3,C22
`Chr8:9458583`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,B53
`Chr8:9458634`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B45,B62,C77
`Chr8:9458823`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B136,B23,C18,C63
`Chr8:9458892`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B52,D11
`Chr8:9459126`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B136,B23,C18,C63

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782806.1

387 aa

194

387

Plant_tran

DDE_Tnp_4

PF04827 Plant_tran 152-347 aa PF13359 DDE_Tnp_4 172-338 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782806.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	152	347	2.8e-12	47.4	Plant transposon protein
`XP_057782806.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	172	338	4.3e-32	111.6	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926823.1
CTGTTCCGCCAATATAAAAAGCCTTCTTACATAAAAAAGACTCAACGAAAAAGCATTCTTAAGAAGGAAGACCCAAACCAACGAGCTCTCTCTGAATACTCTCTCTCTCTCTCTACATATATATATATATTCTTTTGGCGCTGAACGCAAACAACACAACAGAAGCGGCTGCAAACAATTTCCTGAGTGAGGCTTTCATTCAATTTGCACTGATGGGGCCAGTGAGAGGGAATAAAAAGAAAAGGAAAATAGAGAAGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057782806.1_41773
ATGGGGCCAGTGAGAGGGAATAAAAAGAAAAGGAAAATAGAGAAGAAAGCTGAAGAAAACTCTTTGATCTCAGGGTCTTCGGAGGAGGGCTGTACAGAGTGGTGGGAAGTTTTGTTAAAGACAATTGCCGGTAGTCCGTCGTCTTCACAGATATTAGACAACTTCAGATCTACTTTCAAGGTGTCAAGAAAAACTTTTGACTATATATGTTCCCTAGTAAAAGAGCATATGATGGCTAAGACACATTTTGCATTCACAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782806.1
MGPVRGNKKKRKIEKKAEENSLISGSSEEGCTEWWEVLLKTIAGSPSSSQILDNFRSTFKVSRKTFDYICSLVKEHMMAKTHFAFTNGKPMTLNDQVALALVRLGSGNSLISIGDSFGAHHSTVSQVTWRFVEAIEEKGLHHLQWPSAESEMTQIKQKFEKIRGLPNCCGAIDTTHITMLLTSSDQEADTWLDHKQNHSMILQAIVDPDLRFRNIVTGWPGKMTDSSILQSSSFFKQCQKGEKLNGKTTHLSEETELTEY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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