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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001180`

染色体: Chr08 坐标: 9465364-9467543 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001180`
名称	SmilChr08G001180
描述	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	9465364 - 9467543 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000765`
GeneID	`131000765`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000765`
原始查询	`SmilChr08G001180`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2
产物	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2
Arabidopsis	`AT5G47890` (AT5G47890) NADH-ubiquinone oxidoreductase B8 subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834840] identity=62.8; qcov=0.959; evalue=2.64e-42; confidence=medium
Rice	`Os04g0310500` - identity=56.7; qcov=0.99; evalue=6.59e-39; confidence=medium
GO	GO:0005747 (GO:0005747)
KEGG	smil00190 (Oxidative phosphorylation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF05047 (L51_S25_CI-B8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000765

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057782814.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.80000	`XP_057782814.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.20000	`XP_057782814.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782814.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782814.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:9465839`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C14,C7,D9
`Chr8:9466735`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C60,C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782814.1

98 aa

L51_S25_CI-B8

PF05047 L51_S25_CI-B8 28-78 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782814.1`	Pfam	`PF05047`	L51_S25_CI-B8	Domain	28	78	7.2e-18	65.1	Mitochondrial ribosomal protein L51 / S25 / CI-B8 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926831.1
CAGAGTAGCTTGCTATAGGAGAGAACAAGAACATACACAGCCGAAGCACATAAAGGTTTCAACAATGGCGTGGAGGGGACAGCTTTCTCGAAATCTCAAGGAGCTCCGCATCTTATTCTCTCCTAATTCGTCTTCCAGCTCTTCCACTAGAGCCTTCATTGAGAATAATTACAAGGATCTGAAGACAAAAAACCCTAAGCTCCCGATTTTGATCCGCGAGGCCACTGGCATCGAGCCTCAGCTATGGGCGAGATATGGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000765
ATGGCGTGGAGGGGACAGCTTTCTCGAAATCTCAAGGAGCTCCGCATCTTATTCTCTCCTAATTCGTCTTCCAGCTCTTCCACTAGAGCCTTCATTGAGAATAATTACAAGGATCTGAAGACAAAAAACCCTAAGCTCCCGATTTTGATCCGCGAGGCCACTGGCATCGAGCCTCAGCTATGGGCGAGATATGGATTTGGCGTTGAGAGGGGAATACACTTGGAAGGTTTGAGCGAGGAACAGATTTCTAAGGCTCTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782814.1
MAWRGQLSRNLKELRILFSPNSSSSSSTRAFIENNYKDLKTKNPKLPILIREATGIEPQLWARYGFGVERGIHLEGLSEEQISKALEDLNKAGAGLKS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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