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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001191`

染色体: Chr08 坐标: 9561666-9566749 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001191`
名称	SmilChr08G001191
描述	telomere repeat-binding protein 1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	9561666 - 9566749 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000776`
GeneID	`131000776`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000776`
原始查询	`SmilChr08G001191`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	telomere repeat-binding protein 1-like
产物	telomere repeat-binding protein 1-like
Arabidopsis	`AT1G07540` (TRFL2) TRF-like 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837268] identity=43.5; qcov=1.02; evalue=1.56e-148; confidence=medium
Rice	`Os03g0274300` - identity=51.9; qcov=0.633; evalue=3.12e-121; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding); PF23603 (Ubiquitin_TPR1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000776

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782830.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782830.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782830.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782830.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057782830.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:9563350`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:9563365`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B138,B71,C59
`Chr8:9563718`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B128
`Chr8:9563736`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,B52
`Chr8:9563992`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34
`Chr8:9564056`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B16,B93,C13,C29,C43
`Chr8:9564243`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr8:9564503`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr8:9564755`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr8:9564932`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr8:9566221`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B55,C2,D10
`Chr8:9566268`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782830.1

694 aa

347

694

Ubiquitin_TPR1

Myb_DNA-binding

PF23603 Ubiquitin_TPR1 401-469 aa PF00249 Myb_DNA-binding 595-644 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782830.1`	Pfam	`PF23603`	Ubiquitin_TPR1	Domain	401	469	4.4e-39	132.8	Telomere repeat-binding protein 1-like, ubiquitin-like domain
`XP_057782830.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	595	644	6.9e-06	26.8	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926847.1
GTTGGGGTTTAAGCTATGGTGTGGAAGCCGGAAGAGGTGGTTTTCACAGGGTTTTTGGCTATCTTTTCAATTTCAACCGAAAGAAACAAAATAAGAAATTAGATTACAAAATAAAAAATAAAAAAATTGATGGGGGGAATTGAGTGACATTCTTCAACTTTTTTTTTTTGGTTTGATTTTCTGATCGTGAAAAAATAGATTAGATGATTTTGGTTGTTGAAGATTCAAGATGAAATGTTTCAGAATGGAAAAGTTTTGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000776
ATGGCATTGCAGAAGAGATTAGAGTATGGATTTAATGGCTATCAGGTGCCTCCGACTCCTCGAGCTGCCAGATCAGTTAGGAGGAGGAGCTTATTTAAGAGGAAAGCTGATGACAACCAAATGTGTGCATTTGACTTATTAGCAACCGTAGCTGGGAAGTTACTCTTGGATGGCGAAAGTCTGCCATCTGCAAATACAAATGCTGGAAAAGAGCAGCCTCCTACTCTGGGAAATTCTGTCGGGAAGGAAGATAAGGGTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782830.1
MALQKRLEYGFNGYQVPPTPRAARSVRRRSLFKRKADDNQMCAFDLLATVAGKLLLDGESLPSANTNAGKEQPPTLGNSVGKEDKGENKPLEEKSCDRDCYERNFLFTEIVSEAPNPNLCSNELACPQNDIISRPASGITSSDCSEKFGSAEQLVNDDCKLSLGISTPSVDIESSGLRLSANSGSEDESRKGRKDIKLDSANIRNLSISNKVSLGSSVRPEASDRKSSALVCSVDSVKFPFCRDRTSCGPFPVNRENVKL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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