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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001197`

染色体: Chr08 坐标: 9646306-9649297 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001197`
名称	SmilChr08G001197
描述	uncharacterized SmilChr08G001197
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	9646306 - 9649297 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000784`
GeneID	`131000784`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000784`
原始查询	`SmilChr08G001197`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0144600; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os01g0144600; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G59460` (AT5G59460) scarecrow-like transcription factor 11 (SCL11) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836065] identity=44.9; qcov=1; evalue=6.63e-34; confidence=medium
Rice	`Os01g0144600` - identity=43.9; qcov=1.07; evalue=3.17e-39; confidence=medium
GO	GO:0000460 (maturation of 5.8S rRNA)
KEGG	smil03018 (RNA degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF10175 (MPP6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000784

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782835.1`
2	Nucleolus	核仁	0.40000	`XP_057782835.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057782835.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782835.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782835.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:9646763`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B71
`Chr8:9646763`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B71
`Chr8:9648632`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	174	A1,A11,A14,A15,A16,A18,A19,A2,A21,A23,A24,A25,A5,A6,A8,B1,B10,B100,B101,B102,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B110,B111,B113,B114,B115,B117,B118,B119,B12,B120,B121,B124,B125,B126,B128,B129,B130,B132,B133,B134,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B25,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B34,B36,B38,B39,B41,B46,B47,B50,B54,B55,B56,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B64,B65,B66,B67,B69,B7,B70,B73,B74,B75,B77,B79,B83,B84,B86,B87,B89,B9,B91,B93,B96,B98,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C19,C2,C22,C23,C27,C28,C29,C30,C31,C32,C33,C37,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C56,C6,C60,C64,C66,C68,C69,C7,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C80,C82,C83,C84,C85,C87,C9,D1,D10,D11,D3,D4,D5,D6,D9
`Chr8:9648636`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	176	A1,A11,A14,A15,A16,A18,A19,A2,A21,A23,A24,A25,A5,A6,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B102,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B110,B111,B113,B114,B115,B117,B118,B119,B12,B120,B121,B124,B125,B126,B128,B129,B130,B132,B133,B134,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B25,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B34,B36,B38,B39,B41,B46,B47,B50,B54,B55,B56,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B64,B65,B66,B67,B69,B7,B70,B73,B74,B75,B77,B79,B83,B84,B86,B87,B89,B9,B91,B93,B96,B98,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C19,C2,C22,C23,C27,C28,C29,C30,C31,C32,C33,C37,C38,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C5,C50,C51,C52,C54,C56,C57,C6,C60,C64,C66,C68,C69,C7,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C80,C82,C83,C84,C85,C87,C9,D1,D10,D11,D3,D4,D5,D6,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782835.1

185 aa

185

MPP6

PF10175 MPP6 5-96 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782835.1`	Pfam	`PF10175`	MPP6	Family	5	96	6e-09	37.1	M-phase phosphoprotein 6

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926852.1
GATTTTCTTCTTTCTTTCTTTTTTTTAGAGAAAAAGGGAAAAGATCTTATTGCAAATCACGAGTAGCAAAAAATAGTTTTAAGCATTAAATATTTTTATTGAGAGAATCCTTTTTCCATTGTGGAAATAATATTTGACTTAATTATTGGGTTTGAGAGAAAACAGTAGCCGCGGCCCGCGGGTTTGTCAAAATTTTTGGGGATAATTGGGTCATTCCGCTTTGATTTTGTAGTATGCCAAACCCTTGCCAATCGAACCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000784
ATGGCGAAGCGAGAGCTATCCACTACTCTGAAGAACTTAAAGTTCATGCAAAGGGCTTCTCAGAAAGAGGAGAAAACCAAGAAAGAAGAAGAGGTCGTGCCTGCATCAGATTTCCCTGCCTGCAGCGCTACTAAAAGATGCATTGTTATAGTTGAAGGTGATCCGCATCCAGGGGCAACAAGAGGTCGCATGTCATTTTTAAGTTTTAATCCATCTATTGATAAACTCAATGAAGAAGCATCCAGCCCTAGTGAAACTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782835.1
MAKRELSTTLKNLKFMQRASQKEEKTKKEEEVVPASDFPACSATKRCIVIVEGDPHPGATRGRMSFLSFNPSIDKLNEEASSPSETESAATSSGRQNESFRENGSPQCRSDDLGLDSSSNDSNGNHKRKQHDSGTEAETPSKSRKSDQDNQDSNPARSRSSQKKNKREKLDWNVLRPPKYQSKKR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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