Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001203`

染色体: Chr08 坐标: 9721626-9722456 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001203`
名称	SmilChr08G001203
描述	small polypeptide DEVIL 13-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	9721626 - 9722456 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000790`
GeneID	`131000790`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000790`
原始查询	`SmilChr08G001203`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	small polypeptide DEVIL 13-like
产物	small polypeptide DEVIL 13-like
Arabidopsis	`AT5G59510` (RTFL5) ROTUNDIFOLIA like 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836070] identity=48.28; qcov=0.808; evalue=5.34e-15; confidence=low
Rice	`Os03g0272900` - identity=36.84; qcov=0.949; evalue=3.17e-14; confidence=low
GO	GO:0008285 (negative regulation of cell population proliferation)
KEGG	-
Pfam	PF08137 (DVL)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000790

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057782850.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057782850.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057782850.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:9722012`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr8:9722082`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B106,B34,C65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782850.1

99 aa

DVL

PF08137 DVL 74-92 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782850.1`	Pfam	`PF08137`	DVL	Family	74	92	1.7e-11	44.4	DVL family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926867.1
AACGAGATCCAGCATAGAATTTGGCTGCAAATTATAAAGTAAGGTGCAAAGCCTGACCATTTTACTCAAGCATCCACATGTGATGCTGCTACACAACAGTCGTCAATAACACCCACCACACCACCATTGTCTCCACACTAGTATATATTGTCCCACCACCACCTCATCTCACAACTCTATCTCTCTCTCTCTCTACATATCCATCCCTCTCTCATTAGCATCAGCATCAGCATCATCAACATCAGCATTGGCAAGGAGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057782850.1_41805
ATGGAGTATTACATGGATGAGAAATGGAAGTTATCCAAAGAAGATAGGCCGCATTCCTCCTCCAAAGCGTCTATGTCGAGGAGCGTCTCCACTAAGTCATCGCTTCAGAAGAGCTTCTCCACCAAGAACCCCTTCGGCCACTCCTCCTCTAAATCCTCCCTCCCGAGAAGCTCCTCCCAGAGGTGCTCCGGTTTCACGCGCAAGTGCACCAACTTGGCCAAGGAGCAGAAGGCCAAATTCTACATTGTCAAGCGCTGCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782850.1
MEYYMDEKWKLSKEDRPHSSSKASMSRSVSTKSSLQKSFSTKNPFGHSSSKSSLPRSSSQRCSGFTRKCTNLAKEQKAKFYIVKRCITMLVSWKKNGDS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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