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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001216`

染色体: Chr08 坐标: 9817680-9820571 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001216`
名称	SmilChr08G001216
描述	ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	9817680 - 9820571 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000805`
GeneID	`131000805`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000805`
原始查询	`SmilChr08G001216`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10
产物	ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10
Arabidopsis	`AT3G07525` (ATG10) autophagocytosis-associated family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819941] identity=49.5; qcov=0.965; evalue=1.05e-67; confidence=high
Rice	`Os12g0506800` (OsATG10b) - identity=40.7; qcov=0.983; evalue=1.28e-49; confidence=medium
GO	GO:0005622 (intracellular anatomical structure); GO:0006497 (protein lipidation); GO:0016236 (macroautophagy); GO:0019777 (Atg12 transferase activity); GO:0032446 (protein modification by small protein conjugation)
KEGG	smil04136 (Autophagy - other - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03987 (Autophagy_act_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000805

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782873.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057782873.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057782873.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782873.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782873.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:9817958`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr8:9817981`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C48
`Chr8:9817981`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr8:9818273`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:9819311`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr8:9819953`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,B48
`Chr8:9820168`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A4,B12,B130,B137,B28,B77,B78,B80,C5
`Chr8:9820170`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	9	A4,B12,B130,B137,B28,B77,B78,B80,C5
`Chr8:9820367`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C52,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782873.1

230 aa

115

230

Autophagy_act_C

PF03987 Autophagy_act_C 21-220 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782873.1`	Pfam	`PF03987`	Autophagy_act_C	Domain	21	220	1.6e-43	149.7	Autophagocytosis associated protein, active-site domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926890.1
CAAAACGACAAATTTTTGTATGCACAACTGCACAAGTATAAATCAACTTATTAGGTGATTCGATTCCGAACGTCGTCTGGGCGGATTGTAGGAAGGGAATCCTGATTTCATTGTACTTGAGAATTTGATGGTGGAATCTTGGGACGGCACCCTTTCTTGCACTGAGTTCTTCGTTGCAGCTTCCACTTTTTCGGAGCAGTGGCGGAAATTCAATTCATCTTTACCTCAATGGACATGGATTCCTTCCCCTAAACGGCCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000805
ATGGTGGAATCTTGGGACGGCACCCTTTCTTGCACTGAGTTCTTCGTTGCAGCTTCCACTTTTTCGGAGCAGTGGCGGAAATTCAATTCATCTTTACCTCAATGGACATGGATTCCTTCCCCTAAACGGCCCTGGCTTTCCACTAATGATCAAGTGGGATACTTGTCCCTGGAAAATGTAATTCTTCCCAGGTTATCAGAGGGAGCTGCTCATTACAGCAGCGATGTGGCGGAGAAAGAAGAGTGCTGTAGTGATTGTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782873.1
MVESWDGTLSCTEFFVAASTFSEQWRKFNSSLPQWTWIPSPKRPWLSTNDQVGYLSLENVILPRLSEGAAHYSSDVAEKEECCSDCEDEVVDTAVVVLNDGPVEHRYDLHAVYSASYRVPVLYFRAYHSDGQPLLLDVIEKDIPIDSAQLLARAKWTFITQEEHPELRRPWYTLHPCGTSEWMKLLLSSDISAAQNRIPLEKYLLSWFSVVGQVFGIKLPFEMLNLVASQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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