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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001217`

染色体: Chr08 坐标: 9822022-9824760 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001217`
名称	SmilChr08G001217
描述	rhodanese-like domain-containing protein 4A, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	9822022 - 9824760 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000806`
GeneID	`131000806`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000806`
原始查询	`SmilChr08G001217`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	rhodanese-like domain-containing protein 4A, chloroplastic
产物	rhodanese-like domain-containing protein 4A%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G25480` (AT3G25480) Rhodanese/Cell cycle control phosphatase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822132] identity=53.4; qcov=0.626; evalue=5.63e-75; confidence=high
Rice	`Os01g0889800` (OsStr13) - identity=52.1; qcov=0.787; evalue=2.42e-83; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF28687 (STR4A_N); PF30980 (STR4_M)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000806

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057782874.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057782874.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.40000	`XP_057782874.1`
4	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.20000	`XP_057782874.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782874.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:9822514`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B1,B109,B24,C51
`Chr8:9822514`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B109,B24,C51
`Chr8:9823538`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	9	A2,B108,B52,B6,B70,C45,C46,C65,C78
`Chr8:9823612`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	A2,B52,B6,B70,C65,C78
`Chr8:9823969`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr8:9824527`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B24,B46,C46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782874.1

356 aa

178

356

STR4A_N

STR4_M

PF28687 STR4A_N 113-147 aa PF30980 STR4_M 152-266 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782874.1`	Pfam	`PF28687`	STR4A_N	Domain	113	147	8.4e-22	77.2	STR4A N-terminal domain
`XP_057782874.1`	Pfam	`PF30980`	STR4_M	Domain	152	266	2.1e-38	131.7	STR4 middle domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926891.1
TGAAGGCGAAAGTGGTGAAAACTGATAAAGGCCGTTGCATATGGCGCCATCTTATCATATAATTCATCATATCATCGATCCATATGTAGTCCAGCCAATTCTCTCTCTCTCTTCATGGAGTCTCTTTCCAGATGCCTCTCAGCTTTCCCACCATTATTAAACCCTTCTATAAAACCCCGGAAAACAACTCCAAAAACACATCTTTTCCTCCTAAATTGCAATCCCACACTTATCGAAACTCAAATCCCAAATCACCAATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000806
ATGGAGTCTCTTTCCAGATGCCTCTCAGCTTTCCCACCATTATTAAACCCTTCTATAAAACCCCGGAAAACAACTCCAAAAACACATCTTTTCCTCCTAAATTGCAATCCCACACTTATCGAAACTCAAATCCCAAATCACCAATCAAGCAACACTTCAACAACCGCCATTTCCCCTCACAATTTGTCCGAAAATCCCAATTCCCACAAACTAGTACTCCTCAAACCCCAATTCTCATTGCCCTTTCTTGGATTCACATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782874.1
MESLSRCLSAFPPLLNPSIKPRKTTPKTHLFLLNCNPTLIETQIPNHQSSNTSTTAISPHNLSENPNSHKLVLLKPQFSLPFLGFTFPISCFASETTAALPTEEVPGRINLESILVSIDNFFNRYPFFVATVVFIWLVAIPLAEEYSQKYKFISAINAFKKLQDDPTAQLLDIRDDKSIASLGSPNLKILSKNTVQVRFREGDEEGFVKRVLKNFGEPANTTLCILDNFGGNSMKVAELLVKNGFKEAYAIRGGTMGKKG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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