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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001220`

染色体: Chr08 坐标: 9832576-9835619 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001220`
名称	SmilChr08G001220
描述	FRIGIDA-like protein 3
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	9832576 - 9835619 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000808`
GeneID	`131000808`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000808`
原始查询	`SmilChr08G001220`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	FRIGIDA-like protein 3
产物	FRIGIDA-like protein 3
Arabidopsis	`AT5G48385` (AT5G48385) FRIGIDA-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834893] identity=56.4; qcov=1.06; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0248300` - identity=52.7; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07899 (Frigida)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000808

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782876.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057782876.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782876.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782876.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782876.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:9832812`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B139,B81,C21,C81
`Chr8:9832863`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B6
`Chr8:9832920`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,B26
`Chr8:9833073`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,B8
`Chr8:9833088`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:9833112`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B100,B26
`Chr8:9833345`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,B101
`Chr8:9833685`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,B48
`Chr8:9833687`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B115
`Chr8:9833695`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr8:9833819`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,B48
`Chr8:9833861`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782876.1

537 aa

268

537

Frigida

PF07899 Frigida 164-461 aa

XP_057782877.1

537 aa

268

537

Frigida

PF07899 Frigida 164-461 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782876.1`	Pfam	`PF07899`	Frigida	Family	164	461	5.7e-107	358.0	Frigida-like protein
`XP_057782877.1`	Pfam	`PF07899`	Frigida	Family	164	461	5.7e-107	358.0	Frigida-like protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926894.1
AGCAATTTGAGTAGTGGCAGAATAAAAAAGGTGAATGTAATAAGGGAGATGCACGTGGTGTCAGCGTGAGAGAGTGCGCGCTTTTTGTGCGTGTAGCTGTCGGAGAGACGTAAATATACTCTTCCACACTTTCCTCTTTCCAAGAACCAACATTCTATTTCTCTCTCTAGGGATTCCCAATCCGCAAACCAAACCCTCGCTCCCTGCCAAAACATGCCCTGAATTTCTAATCTCTCCGCCGCACTCCCATTCTCCGCCGC...

XM_057926893.1
AGTGCGCGCTTTTTGTGCGTGTAGCTGTCGGAGAGACGTAAATATACTCTTCCACACTTTCCTCTTTCCAAGAACCAACATTCTATTTCTCTCTCTAGGGATTCCCAATCCGCAAACCAAACCCTCGCTCCCTGCCAAAACATGCCCTGAATTTCTAATCTCTCCGCCGCACTCCCATTCTCCGCCGCCGCCGCCGCCGATCGCTCATGCTTTGTTCAGGATTTCTATGTCATGGAAGACAACTTATCCACCGCCACTCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131000808
ATGGAAGACAACTTATCCACCGCCACTCTGATTGGCTCTACAGCCTCTAAGATACAACAACTTCAGAAAGCATTTGCAGAACTTGAAAGTCATCGAGCCGTCACTCTCAATGTGAAATGGAAGCAACTAGAAGAGCATTTTCATGGACTTCAGAAGTCTCTGAAGAGGCGTTTCACAGAACTGGAAGAACAAGAAAAAGACTTCGACACTAAAATAGTTGAATCCAAGGAGATGTTGGAGAAGCGTAAAACAGCTGTAAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057782876.1
MEDNLSTATLIGSTASKIQQLQKAFAELESHRAVTLNVKWKQLEEHFHGLQKSLKRRFTELEEQEKDFDTKIVESKEMLEKRKTAVMSKEQASLQRLQEKRDAAVSAILTAMQKCEMPLSVDSGVSNGQNQIEAPVPDEKIPDALVIEGSMDVMKRSVESMNVEVKSYPELVNLCQEMNSEGLHKFISDNRKNLAALREEIPTALKAAADPASLILDSLKGFYGTDMPNIDAKKDSNLLGLRRTCIMLMECLCSLSINLD...

XP_057782877.1
MEDNLSTATLIGSTASKIQQLQKAFAELESHRAVTLNVKWKQLEEHFHGLQKSLKRRFTELEEQEKDFDTKIVESKEMLEKRKTAVMSKEQASLQRLQEKRDAAVSAILTAMQKCEMPLSVDSGVSNGQNQIEAPVPDEKIPDALVIEGSMDVMKRSVESMNVEVKSYPELVNLCQEMNSEGLHKFISDNRKNLAALREEIPTALKAAADPASLILDSLKGFYGTDMPNIDAKKDSNLLGLRRTCIMLMECLCSLSINLD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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