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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001252`

染色体: Chr08 坐标: 9936875-9939537 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001252`
名称	SmilChr08G001252
描述	endo-1,4-beta-xylanase 5-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	9936875 - 9939537 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000817`
GeneID	`131000817`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000817`
原始查询	`SmilChr08G001252`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	endo-1,4-beta-xylanase 5-like
产物	endo-1%2C4-beta-xylanase 5-like
Arabidopsis	`AT4G33840` (AT4G33840) Glycosyl hydrolase family 10 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829526] identity=44.5; qcov=0.919; evalue=4.22e-155; confidence=medium
Rice	`Os03g0201500` - identity=40.1; qcov=0.95; evalue=4.03e-136; confidence=medium
GO	GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00331 (Glyco_hydro_10); PF02018 (CBM_4_9)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000817

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057782892.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782892.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782892.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782892.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782892.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:9937020`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,B53
`Chr8:9937208`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B114,B2
`Chr8:9937208`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B114,B2
`Chr8:9937214`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B2
`Chr8:9937214`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B2
`Chr8:9937494`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr8:9937711`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr8:9938338`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B138,B15,C1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782892.1

580 aa

290

580

CBM_4_9

Glyco_hydro_10

PF02018 CBM_4_9 49-162 aa PF00331 Glyco_hydro_10 229-488 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782892.1`	Pfam	`PF02018`	CBM_4_9	Domain	49	162	4.1e-09	37.6	Carbohydrate binding domain
`XP_057782892.1`	Pfam	`PF00331`	Glyco_hydro_10	Domain	229	488	4.3e-34	118.9	Glycosyl hydrolase family 10

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926909.1
CCTGTGCGACCGACAAGTCCAAGCAGGCCAAGAACCGCCCCCTAAATACAAGGGGTAAACGGAACAGCTCTAAAAAATATAAACCAGACCATGTAATCACTTCAAAACATATCATACGCACTTATTACATGAAAGTATAAAAAAGTGGATCTTGCAACTAAAATTCAATCATCTTACAAGTTTTAGCAAATGCAAGACCAATTCAAACCCGTTTTAGCGTGATTGTTAGAAAATGATGAGTGAAGGCCCACCATTCTCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000817
ATGAAGACCACTTTCAATTCTTTTCTCTTCACATTTTTCACTCTAAGTATTTTCTTAGGTTTTCAAGTGTATGCGGTGCCGTATGATTACTCATACGTACTTGGGTGTGTGGCGAAGCCCGGGGCGCCGCAATACAAGGGCGGAATCGCCGTAAATCCGGAATTCGACGAAGAACTCAAGGGATGGGCAGCAGCTGGAAATGCCAAAATATCAACTGCCAAATCGCCCGACGGCAATGCATACGCCGTCGTTTCTAACAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782892.1
MKTTFNSFLFTFFTLSIFLGFQVYAVPYDYSYVLGCVAKPGAPQYKGGIAVNPEFDEELKGWAAAGNAKISTAKSPDGNAYAVVSNIVTPQSDGLSLAFNVEKGKLYTVSAWFQISEGEAAVQGKVVTSTGNKTANFITAKAGCWTMFKGGFHVNVTEPAALHFDTNSTGFDMWVDSVSLQPFTQEEWNSHQAESLEKVRKAKVKFEVADQLGKAVADASVSIKQREPHFPFGCAMNFLIVKNEAYQKWFLEKGFRYAVF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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