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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001261`

染色体: Chr08 坐标: 9987921-9993081 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001261`
名称	SmilChr08G001261
描述	uncharacterized SmilChr08G001261
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	9987921 - 9993081 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000872`
GeneID	`131000872`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000872`
原始查询	`SmilChr08G001261`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os10g0346200; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os10g0346200; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G14835` (AT2G14835) RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815972] identity=64.2; qcov=1.01; evalue=3.84e-159; confidence=high
Rice	`Os10g0346200` - identity=60.4; qcov=1.08; evalue=3.46e-162; confidence=high
GO	GO:0005794 (Golgi apparatus)
KEGG	-
Pfam	PF25993 (zf-B_box_ZFPL1); PF25998 (U-box_ZFPL1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000872

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057782985.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.80000	`XP_057782985.1`
3	Endosome membrane	内体膜	0.60000	`XP_057782985.1`
4	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.40000	`XP_057782985.1`
5	Endosome	内体	0.40000	`XP_057782985.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:9988710`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:9990083`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,B46
`Chr8:9990171`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr8:9990253`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,C57
`Chr8:9991565`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B13
`Chr8:9991741`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr8:9991981`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,B34

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782985.1

339 aa

170

339

zf-B_box_ZFPL1

U-box_ZFPL1

PF25993 zf-B_box_ZFPL1 1-45 aa PF25998 U-box_ZFPL1 53-129 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782985.1`	Pfam	`PF25993`	zf-B_box_ZFPL1	Domain	1	45	2.7e-21	76.0	ZFPL1-like, B-box zinc-binding domain
`XP_057782985.1`	Pfam	`PF25998`	U-box_ZFPL1	Domain	53	129	1.1e-40	138.5	ZFPL1-like, U-box domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927002.1
ACACAGAAATATACTATAAAAAGTTATCTTCATTTTCAAGTTCTTGAGCGACTGCTCTTCACGCATGTTTTTTTTCTCTTCGAATTTATGAATGTTTAGACTAGGTGTTGATAGATAGCTTACCACAAACAGGTTCAACACTCAAATTTTAGATTTCTTCATTAGAATATTCTATCGAACAGTCGACGAACATTCCTATTCTTGCATTTGCACCTTCGTGACCTATGCCCACCCGTTACAGACGGCACCTCCGCCTGCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000872
ATGGTGGTCTGCAAATGCCGCAAGGCGACTAAGTTGTATTGCTTCGTCCACAAGGTGCCGGTCTGTGGGGAATGTATATGCTTTCCGGAACACCAAATCTGTGTGGTGCGTACATACTCAGAATGGGTAATTGATGGAGAGTATGATTGGCCTCCTAAATGCTGCCATTGTCAAGCTGAGCTTGCAGAAGGGACAGACCCTCAAACTGCTCGATTGGGCTGTTTGCATGTTATACACGCAAATTGTTTAGTTTCGCATGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782985.1
MVVCKCRKATKLYCFVHKVPVCGECICFPEHQICVVRTYSEWVIDGEYDWPPKCCHCQAELAEGTDPQTARLGCLHVIHANCLVSHVKSFPPQTAPAGYVCPACSTPIWPPKSVKDSGSRLHSKLKEAIMQTGLEKNVFGNHPVPLQGAESRSPPPAFASEPLVHASGTVDKTAASTARPANLDILEIDGYSSGTSSLPNHEPDFMKNTSPTGPGATTRKTAVQVDRQNSEVPYYADDEDANRKKYSRRGSFRHKFLRSL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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