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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001275`

染色体: Chr08 坐标: 10155612-10158243 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001275`
名称	SmilChr08G001275
描述	uncharacterized SmilChr08G001275
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	10155612 - 10158243 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000886`
GeneID	`131000886`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000886`
原始查询	`SmilChr08G001275`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Peroxisomal membrane 22 kDa (Mpv17/PMP22) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815975]; symbol=AT2G14860; hit=AT2G14860; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Peroxisomal membrane 22 kDa (Mpv17/PMP22) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815975]; symbol=AT2G14860; hit=AT2G14860; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G14860` (AT2G14860) Peroxisomal membrane 22 kDa (Mpv17/PMP22) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815975] identity=67.8; qcov=0.667; evalue=1.8e-92; confidence=high
Rice	`Os12g0508100` - identity=67.2; qcov=0.644; evalue=1.65e-84; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0016020 (membrane)
KEGG	smil04146 (Peroxisome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04117 (Mpv17_PMP22)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000886

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057783008.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057783008.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783008.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783008.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783008.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:10156214`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B55,B74,C2
`Chr8:10157878`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:10157933`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	18	A11,A6,B126,B128,B140,B31,B51,B54,B9,C17,C2,C30,C42,C44,C59,C87,D1,D3
`Chr8:10157944`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr8:10157960`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B52,C82
`Chr8:10158045`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783008.1

270 aa

135

270

Mpv17_PMP22

PF04117 Mpv17_PMP22 198-256 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783008.1`	Pfam	`PF04117`	Mpv17_PMP22	Family	198	256	1.7e-19	70.3	Mpv17 / PMP22 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927025.1
TTGGGAGCGTCGCCAAAGGAAAGCTCCCATTAGCTATAAAATTTCCCATTTTGTGGGCTTTTCTCAGTTCTCATGCCTATCACGCAAAACCTCTCCTAAAACCCCATAGCCAAACACCACACTTTCATCGCCATGGCCGCCGCCGCCACTGCTCTTTTCCGCCAACGCCAATCCCTCGTCCGTTCCCTGAAACCCGTTCGCTCCAAACACTCCCTACCCGATCCCCCCAAGAAAGTAGGCAGTCTTCTCGACGACCAACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000886
ATGGCCGCCGCCGCCACTGCTCTTTTCCGCCAACGCCAATCCCTCGTCCGTTCCCTGAAACCCGTTCGCTCCAAACACTCCCTACCCGATCCCCCCAAGAAAGTAGGCAGTCTTCTCGACGACCAACTCCACCAATCAAAATGCTGTTCCCGTTTCCCTCACTCCATCTCGCGCAAATGGAAGGACTTCGAATTCTCCGCTCCCAGTCTCATATCCGCCATTTTCTCATCGAACCGATCTTCCTCTTCGCCGAGATTCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783008.1
MAAAATALFRQRQSLVRSLKPVRSKHSLPDPPKKVGSLLDDQLHQSKCCSRFPHSISRKWKDFEFSAPSLISAIFSSNRSSSSPRFGFVSWYLGMISTRPVATKSVTAALIYTAADLSSQTIVTIVGGNGEGYDLVRTLRMAGYGMLIVGPSLHFWFNFVSRAFPKRDLLSTFAKMALGQMVYGPIVTALFFSVNAGLQGESGSEIVGRLKRDMVPTLVRGVMYWPICDFITFKFVPVHLQPLVSNSFSYMWTVYLTYMA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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