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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001290`

染色体: Chr08 坐标: 10275115-10275861 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001290`
名称	SmilChr08G001290
描述	uncharacterized SmilChr08G001290
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	10275115 - 10275861 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998049`
GeneID	`130998049`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998049`
原始查询	`SmilChr08G001290`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Plant basic secretory protein (BSP) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816001]; symbol=AT2G15130; hit=AT2G15130; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Plant basic secretory protein (BSP) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816001]; symbol=AT2G15130; hit=AT2G15130; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G15130` (AT2G15130) Plant basic secretory protein (BSP) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816001] identity=43.8; qcov=0.911; evalue=1.79e-61; confidence=medium
Rice	`Os10g0490900` - identity=43.2; qcov=0.774; evalue=2.94e-52; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04450 (BSP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998049

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057779468.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057779468.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779468.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779468.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779468.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:10275141`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B118,B18
`Chr8:10275160`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,C21,C36,D6
`Chr8:10275221`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr8:10275309`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B67,B7
`Chr8:10275309`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B67,B7
`Chr8:10275456`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B101,B108,B68,D4
`Chr8:10275573`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,B101
`Chr8:10275603`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,C21,C36,D6
`Chr8:10275717`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779468.1

248 aa

124

248

BSP

PF04450 BSP 26-227 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779468.1`	Pfam	`PF04450`	BSP	Family	26	227	4.3e-50	171.1	Peptidase of plants and bacteria

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923485.1
ATGAATAGGAGAAGCCTCTGCATTTTCCTCCTCCCTGTTTCTCTACTTCTATCATGCCTACTACAACAAACTCATGCAGTCAGATACGTCGTGACAAATACCGTCCCCAACACTCCGGGAGGCCAGTTGTTCGACAGAGAAATCGGGGTTAATTTCACCTTATCAATCATGCCAACTATCAATGATTTCATTTATAAAGTCTTTGAAGAAAGAAGCCCTGCAGAGAGAAGGAATGTGCCTGTTTTGAATGTATACATCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998049
ATGAATAGGAGAAGCCTCTGCATTTTCCTCCTCCCTGTTTCTCTACTTCTATCATGCCTACTACAACAAACTCATGCAGTCAGATACGTCGTGACAAATACCGTCCCCAACACTCCGGGAGGCCAGTTGTTCGACAGAGAAATCGGGGTTAATTTCACCTTATCAATCATGCCAACTATCAATGATTTCATTTATAAAGTCTTTGAAGAAAGAAGCCCTGCAGAGAGAAGGAATGTGCCTGTTTTGAATGTATACATCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779468.1
MNRRSLCIFLLPVSLLLSCLLQQTHAVRYVVTNTVPNTPGGQLFDREIGVNFTLSIMPTINDFIYKVFEERSPAERRNVPVLNVYISEFPGYAYKNGDNINISASALYNMYRPRSVSKWMFTSVMYHEMTHVFQWHGNFGAPGGLTEGTADYVMVKSGYYNQAYYTRPGAGKRWDEGYGVTERFLEYCDSLLQGFTAKLNKKMMYKYSDVYWVELLGKPVDQLWREYKAKYGNQPAEDSIDIFQGLKY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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