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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001294`

染色体: Chr08 坐标: 10312578-10315558 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001294`
名称	SmilChr08G001294
描述	reticulon-like protein B11
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	10312578 - 10315558 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000909`
GeneID	`131000909`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000909`
原始查询	`SmilChr08G001294`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	reticulon-like protein B11
产物	reticulon-like protein B11
Arabidopsis	`AT3G19460` (AT3G19460) Reticulon family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821480] identity=56.9; qcov=0.956; evalue=3.08e-75; confidence=high
Rice	`Os04g0670000` - identity=54.9; qcov=1; evalue=2.75e-57; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02453 (Reticulon)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000909

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057783036.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057783036.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783036.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783036.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783036.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:10313918`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr8:10314092`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,C82
`Chr8:10314169`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783036.1

204 aa

102

204

Reticulon

PF02453 Reticulon 18-172 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783036.1`	Pfam	`PF02453`	Reticulon	Family	18	172	3.6e-53	180.4	Reticulon

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927053.1
TCAACGTTTATTTATGATTGTGAATGCAATAAGGGGTGATCGTGGGGGAAATTGCTACTTTGCCCTTAATTATACTTTTGTTAATCTTGGGTGCAAAAGTAACGTGAAATGAAGAAGTAGGAAAACCGCATCTAGTTTGGACTGCAGAGTAAAATTGGGAAATCGACAGTCGTCTTCAAATTCTCCCTCCCTCGATTTCCTGAATCTCTCAACTTCCTATTTACATTTCAAAAGCCCTAATTTTCCATGGAAAAATCTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000909
ATGGAAAAATCTCGTCGATCTTCTGTTCATCGCACGTTAGGCGGTGGTGCAGTTGCTGATGTGATACTGTGGAGAAAATGGACTCTCAGCGCCGCTTTTCTCGTGGGCTCAACTGCGCTTTGGTTCCTATTCGAGAGGGCTGGATACAATTTACTGTCATTTATATCGAATGTTTTATTGTTGCTCATCGTGATACTATTCTTTTGGGCTAAATCTGCGTCGATTCTTAATAGACCACTGCCGCCTCTTCCTAATCTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783036.1
MEKSRRSSVHRTLGGGAVADVILWRKWTLSAAFLVGSTALWFLFERAGYNLLSFISNVLLLLIVILFFWAKSASILNRPLPPLPNLEISEEASVKAADELRVWVNYALSIAHDIAIGGNWRVFLKVATLLWVISYIGSFFNSLTLIYIGVLVSLSLPVLYEKYQNPIDDKLSVAYNIARIQYEKIDSLVLQKIPLASKKEKKTE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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