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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001303`

染色体: Chr08 坐标: 10378509-10379674 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001303`
名称	SmilChr08G001303
描述	protein IRX15-LIKE-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	10378509 - 10379674 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000878`
GeneID	`131000878`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000878`
原始查询	`SmilChr08G001303`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein IRX15-LIKE-like
产物	protein IRX15-LIKE-like
Arabidopsis	`AT5G67210` (IRX15-L) IRREGULAR XYLEM protein (DUF579) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836856] identity=49.5; qcov=0.929; evalue=3.48e-99; confidence=high
Rice	`Os06g0687600` (CDC2) - identity=56.2; qcov=0.676; evalue=6.89e-81; confidence=high
GO	GO:0045492 (xylan biosynthetic process)
KEGG	-
Pfam	PF21729 (IRX15_IRX15L_GXM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000878

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057782996.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782996.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782996.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782996.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782996.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:10378602`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr8:10378648`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B105,B118,B18,B70
`Chr8:10378811`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B105,B118,B18,B70
`Chr8:10379008`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr8:10379009`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr8:10379089`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	50	A10,A11,A14,A20,A24,A6,A7,B1,B119,B12,B132,B19,B2,B22,B25,B30,B31,B37,B42,B47,B48,B49,B51,B57,B65,B67,B68,B73,B74,B86,B97,C14,C17,C20,C22,C30,C38,C4,C49,C6,C60,C61,C64,C65,C72,C73,C81,C82,C87,D7
`Chr8:10379094`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	49	A10,A11,A14,A20,A24,A6,A7,B1,B119,B12,B132,B19,B2,B22,B25,B30,B31,B37,B47,B48,B49,B51,B57,B65,B67,B68,B73,B74,B86,B97,C14,C17,C20,C22,C30,C38,C4,C49,C6,C60,C61,C64,C65,C72,C73,C81,C82,C87,D7
`Chr8:10379096`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	48	A10,A11,A14,A20,A24,A6,A7,B1,B119,B12,B132,B19,B2,B22,B25,B30,B31,B37,B47,B48,B49,B51,B57,B65,B67,B68,B73,B74,B86,B97,C14,C17,C20,C22,C30,C4,C49,C6,C60,C61,C64,C65,C72,C73,C81,C82,C87,D7
`Chr8:10379119`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	47	A10,A11,A14,A20,A24,A7,B1,B119,B12,B13,B132,B19,B2,B22,B25,B30,B31,B37,B47,B48,B49,B51,B57,B65,B67,B68,B73,B74,B86,B97,C14,C17,C20,C22,C30,C4,C49,C6,C60,C61,C64,C65,C72,C73,C81,C82,C87
`Chr8:10379123`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	47	A10,A11,A14,A20,A24,A7,B1,B119,B12,B13,B132,B19,B2,B22,B25,B30,B31,B37,B47,B48,B49,B51,B57,B65,B67,B68,B73,B74,B86,B97,C14,C17,C20,C22,C30,C4,C49,C6,C60,C61,C64,C65,C72,C73,C81,C82,C87
`Chr8:10379134`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	A14,A20,B1,B19,B30,B57,C49,C6
`Chr8:10379219`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C12

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782996.1

324 aa

162

324

IRX15_IRX15L_GXM

PF21729 IRX15_IRX15L_GXM 112-299 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782996.1`	Pfam	`PF21729`	IRX15_IRX15L_GXM	Domain	112	299	1.3e-77	260.4	IRX15/IRX15L/GXM

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927013.1
ATCCTTATTATATAATGATTCGTCACAATTTAATTTTATATGTATCTAACTTAAAAAGTGATAAGTTATTGTAATTCTAAAAAAAAAACAGTGATAAGTTAGTAAAAATAAAGATGAGAAAGAAGTTTAAATACGCACCCAATAATCTTGGATTCCTCCGTGTCACAATTCGAATTAAAGCTTTGTTTCTCCACTACTTCCTTTTCCTTCCGATGAAGACTGTCCCAAAGTTCACAATTATCCACCCCTACAAGACCGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000878
ATGAGAAAGAAGTTTAAATACGCACCCAATAATCTTGGATTCCTCCGTGTCACAATTCGAATTAAAGCTTTGTTTCTCCACTACTTCCTTTTCCTTCCGATGAAGACTGTCCCAAAGTTCACAATTATCCACCCCTACAAGACCGTCGGCGGCGGCGATCACCGCTTTCGGATCGCCGCTCTCGCACTCTTCCTCGTCTTCGCTTTCACCTTCTTTCTCAATCTCATCGCCACGAGAGACGCCGCCGCGGCCCAATCTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782996.1
MRKKFKYAPNNLGFLRVTIRIKALFLHYFLFLPMKTVPKFTIIHPYKTVGGGDHRFRIAALALFLVFAFTFFLNLIATRDAAAAQSQLPEAIADALLYYASANITSRMSPAEMESVASVLRRCAAPCNLLVFGLTHETLLWNALNHGGRTVFVDEHSFSVTRIEEQHPSIEAYDVRFTTKVRELRDLIENFEREIEEECRPVQNLLFSDCSLAVNDLPNYMYDVAWDVIVIDGPSGYSSESPGRMASIFTAGVMARSRNG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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