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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001308`

染色体: Chr08 坐标: 10435205-10436309 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001308`
名称	SmilChr08G001308
描述	polyadenylate-binding protein 8-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	10435205 - 10436309 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000935`
GeneID	`131000935`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000935`
原始查询	`SmilChr08G001308`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	polyadenylate-binding protein 8-like
产物	polyadenylate-binding protein 8-like
Arabidopsis	`AT1G49760` (PAB8) poly(A) binding protein 8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841399] identity=59.7; qcov=0.802; evalue=9.33e-27; confidence=medium
Rice	`Os04g0504800` (OsPABPC3) - identity=57.7; qcov=0.812; evalue=6.24e-26; confidence=medium
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000935

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057783076.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057783076.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.60000	`XP_057783076.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.60000	`XP_057783076.1`
5	P-body	P-body	0.40000	`XP_057783076.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:10435253`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,B18
`Chr8:10435275`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,B127,C5
`Chr8:10435284`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B137,B48,C53,D1
`Chr8:10435330`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B27,B5,C17,C3,C43
`Chr8:10435331`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,B119
`Chr8:10435385`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr8:10435409`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B97,C9
`Chr8:10435417`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:10435430`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C10,C21,C22,C36,C85
`Chr8:10436222`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,C41,C51

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783076.1

96 aa

RRM_1

PF00076 RRM_1 20-90 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783076.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	20	90	1e-19	70.8	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927093.1
TTAGATTATCACTGCACAAGGTGATCATATCCTATAGGCGAATATGGCGGCGACGGAAGCGAATGTTGTGCCGGGGCAGCTGGCGCCGATTTTGACCGCGCTTTATGTTGGCGACCTTGACGGCAGCGTGACGGAGGAAGAGCTGCTTCGATTGTTCAATCAAGCAGGCGACGTCGTCTCCGTTAAGATATGCATGGATGAAATCAATCAGCGCTCACTTGGATACGGTTATGTCAACTATAGGAATCCTGATGAAGCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000935
ATGGCGGCGACGGAAGCGAATGTTGTGCCGGGGCAGCTGGCGCCGATTTTGACCGCGCTTTATGTTGGCGACCTTGACGGCAGCGTGACGGAGGAAGAGCTGCTTCGATTGTTCAATCAAGCAGGCGACGTCGTCTCCGTTAAGATATGCATGGATGAAATCAATCAGCGCTCACTTGGATACGGTTATGTCAACTATAGGAATCCTGATGAAGCTGAAAAAGCGTTGAATGTTCTGAACTTCACTCGTCTCAATGGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783076.1
MAATEANVVPGQLAPILTALYVGDLDGSVTEEELLRLFNQAGDVVSVKICMDEINQRSLGYGYVNYRNPDEAEKALNVLNFTRLNGKCIRIAYSNK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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