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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001309`

染色体: Chr08 坐标: 10436566-10437499 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001309`
名称	SmilChr08G001309
描述	polyadenylate-binding protein 8-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	10436566 - 10437499 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998052`
GeneID	`130998052`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998052`
原始查询	`SmilChr08G001309`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	polyadenylate-binding protein 8-like
产物	polyadenylate-binding protein 8-like
Arabidopsis	`AT1G49760` (PAB8) poly(A) binding protein 8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841399] identity=54.5; qcov=1.01; evalue=5.46e-78; confidence=high
Rice	`Os08g0314800` (Cen8.t01003) - identity=55.6; qcov=1.02; evalue=3.03e-80; confidence=high
GO	GO:0003730 (mRNA 3'-UTR binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005829 (cytosol); GO:0008143 (poly(A) binding); GO:0008266 (poly(U) RNA binding); GO:1990904 (ribonucleoprotein complex)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998052

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057779470.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057779470.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057779470.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779470.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779470.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:10436640`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr8:10436736`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr8:10436740`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,B64
`Chr8:10436797`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B80,C21,C48,C81
`Chr8:10436827`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B77,C52
`Chr8:10436858`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr8:10436879`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,B64
`Chr8:10436887`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C50
`Chr8:10436887`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C50
`Chr8:10436903`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B80,C19,C34
`Chr8:10436904`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,C10,C78
`Chr8:10436906`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B129,B130,B36,C11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779470.1

219 aa

110

219

RRM_1

PF00076 RRM_1 26-94 aa PF00076 RRM_1 130-198 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779470.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	26	94	1.1e-42	144.4	RNA recognition motif
`XP_057779470.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	130	198	1.1e-42	144.4	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923487.1
ATGTTGTTGCACGGGAAAGAGCTACATGTAGTGCCTTATGTCAGCAAGCAGGAGAGGGTGGCAAAATTCACCAACGTATTTGTGAAGAATATTTCGGCATCCACAACTGAGGGAGATTTGAAGTCGGTATTTGGAGAGTTTGGATCAATGACCAGTGTGGCAGTGATGCGCGACGAAGCAGGAAACTCAAAATGTTTTGGATTTGTCAACTTCTACAATGCAGAGGATGCAGCCAGGTCTGTTGAAGCTCTTAATGGCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998052
ATGTTGTTGCACGGGAAAGAGCTACATGTAGTGCCTTATGTCAGCAAGCAGGAGAGGGTGGCAAAATTCACCAACGTATTTGTGAAGAATATTTCGGCATCCACAACTGAGGGAGATTTGAAGTCGGTATTTGGAGAGTTTGGATCAATGACCAGTGTGGCAGTGATGCGCGACGAAGCAGGAAACTCAAAATGTTTTGGATTTGTCAACTTCTACAATGCAGAGGATGCAGCCAGGTCTGTTGAAGCTCTTAATGGCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779470.1
MLLHGKELHVVPYVSKQERVAKFTNVFVKNISASTTEGDLKSVFGEFGSMTSVAVMRDEAGNSKCFGFVNFYNAEDAARSVEALNGREFSGNEWYVGRAQKKAERELEMKLKRRTTAKEILERSLGMNNVYIKNIDDDVDNDKLKEMFSPFGIITSCKVMTDLRGINRGYGFVAFSTGQEASRAISDMNGKMIGNKPIYVSIAERKEVRHQLIERDYFE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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