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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001313`

染色体: Chr08 坐标: 10464119-10464904 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001313`
名称	SmilChr08G001313
描述	40S ribosomal protein S16
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	10464119 - 10464904 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000925`
GeneID	`131000925`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000925`
原始查询	`SmilChr08G001313`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	40S ribosomal protein S16
产物	40S ribosomal protein S16
Arabidopsis	`AT2G09990` (AT2G09990) Ribosomal protein S5 domain 2-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815456] identity=89; qcov=0.98; evalue=4.16e-95; confidence=high
Rice	`Os12g0124200` (RPS16A) - identity=81.9; qcov=1.01; evalue=7.14e-86; confidence=high
GO	GO:0000462 (maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)); GO:0003723 (RNA binding); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022627 (cytosolic small ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00380 (Ribosomal_S9)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000925

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057783058.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057783058.1`
3	Nucleolus	核仁	0.20000	`XP_057783058.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783058.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783058.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:10464551`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr8:10464602`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr8:10464643`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783058.1

148 aa

148

Ribosomal_S9

PF00380 Ribosomal_S9 16-148 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783058.1`	Pfam	`PF00380`	Ribosomal_S9	Family	16	148	3.9e-38	131.3	Ribosomal protein S9/S16

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927075.1
CAAAATGCTTAATAGTTGAAAGGGCCCAAGATTTTTGTTTACAACCCTAGATAGCCAAATTCATCAGGTGAAGCCTAACCCAGCCCAGCAAAAGGCAGGTAAGTAATTCCGCGAAGAGTATAGATTATTTAACCAAACGCAAAACCCTAATTCCCATTCCATCGTCTTGTAGCATCCCCTTCCCCCACTCTCCCCCCAACCATGGCGACCGCCGCGACCCCGACCACCGAATCTGTCCAATGCTTCGGCCGAAAGAAGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000925
ATGGCGACCGCCGCGACCCCGACCACCGAATCTGTCCAATGCTTCGGCCGAAAGAAGACGGCGGTTGCCGTCACTCACTGCAAGCGCGGACGCGGGCTGATCAAAATCAACGGAGTTCCGATTGAGCTCATCCAGCCAGAAATCCTCCGCTACAAGGCGTTCGAGCCCATCCTCCTCCTCGGTCGCCACCGCTTCGCTGGCGTCGATATGCGTATCCGCGTGAAAGGAGGCGGTCACACCTCCCAGATCTACGCCATCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783058.1
MATAATPTTESVQCFGRKKTAVAVTHCKRGRGLIKINGVPIELIQPEILRYKAFEPILLLGRHRFAGVDMRIRVKGGGHTSQIYAIRQSIAKALVAFYQKYVDEQSKKEIKDILVRYDRTLLVADPRRCEPKKFGGRGARARFQKSYR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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