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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001318`

染色体: Chr08 坐标: 10547829-10549412 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001318`
名称	SmilChr08G001318
描述	U-box domain-containing protein 26-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	10547829 - 10549412 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000854`
GeneID	`131000854`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000854`
原始查询	`SmilChr08G001318`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	U-box domain-containing protein 26-like
产物	U-box domain-containing protein 26-like
Arabidopsis	`AT1G49780` (PUB26) plant U-box 26 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841401] identity=64.1; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0548700` (OsPUB43) - identity=50.5; qcov=1.02; evalue=4.32e-112; confidence=high
GO	GO:0016567 (protein ubiquitination); GO:0061630 (ubiquitin protein ligase activity)
KEGG	-
Pfam	PF04564 (U-box); PF25598 (ARM_PUB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000854

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057782957.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057782957.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057782957.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782957.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782957.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:10548062`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C68
`Chr8:10548178`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B114
`Chr8:10548178`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B114
`Chr8:10548259`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr8:10548426`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C82
`Chr8:10548535`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D5
`Chr8:10548535`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D5
`Chr8:10548537`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr8:10548628`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B56,B96,C82,C85
`Chr8:10548637`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr8:10548854`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr8:10548889`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782957.1

412 aa

206

412

U-box

ARM_PUB

PF04564 U-box 16-87 aa PF25598 ARM_PUB 110-404 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782957.1`	Pfam	`PF04564`	U-box	Domain	16	87	8.3e-22	77.8	U-box domain
`XP_057782957.1`	Pfam	`PF25598`	ARM_PUB	Repeat	110	404	3.8e-76	257.2	Plant U-box protein ARM repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926974.1
ATAAATGTTTCCATTTCCTATATAAATCCAGCACTCCCCCAACAAACTTGAAGAGAATTTACACTCCTCATCCATCCTGTCCCTCCAACTCAAAACGCACAAGAAGAAGAAGAAGCAACAATAGAGTTAACATGCCTGCAAGCTTTAGTTTAGAGCCGTTGGATATCTCGGTGCATATTCCTCACCATTTCCGGTGCCCGATCTCGCTCGAGTTGATGCGCGATCCGGTCACCGTTTGTACCGGTCAGACGTACGACCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000854
ATGCCTGCAAGCTTTAGTTTAGAGCCGTTGGATATCTCGGTGCATATTCCTCACCATTTCCGGTGCCCGATCTCGCTCGAGTTGATGCGCGATCCGGTCACCGTTTGTACCGGTCAGACGTACGACCGCTCAAGCATAGAGGCCTGGGTGGCCACCGGCAATACCACCTGCCCTGTTACAAGGGCGCCGCTCACGGATTTCACTCTCATTCCCAACCACACCCTCCGCCGTCTCATCCAGGATTGGTGCGTCGCCAACCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782957.1
MPASFSLEPLDISVHIPHHFRCPISLELMRDPVTVCTGQTYDRSSIEAWVATGNTTCPVTRAPLTDFTLIPNHTLRRLIQDWCVANRSFGVERIPTPKQPADPVLVRTLLRQAASGPYSLRVSAVRRLRSLARDSDKNRILIAANNAREVLMSIAFADVGLDLRHDSLAVLSVLALSEEECVRVASNSERVGFLVNLLFHSSIDVRVNSAAVIENIVAGIRSPELRAEISGADGVFDGVVGILNYPFIHTRGLKIGIKAL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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