当前解析结果
SmilChr08G001322| 统一新 Gene ID | SmilChr08G001322 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G001322 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G001322 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 10574118 - 10575098 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131000915 |
|---|---|
| GeneID | 131000915 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131000915 |
| 原始查询 | SmilChr08G001322 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | spire, putative (DUF1685) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816052]; symbol=AT2G15590; hit=AT2G15590; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | spire, putative (DUF1685) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816052]; symbol=AT2G15590; hit=AT2G15590; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT2G15590 (AT2G15590)spire, putative (DUF1685) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816052] identity=51.8; qcov=0.806; evalue=2.22e-40; confidence=medium |
| Rice | Os02g0766600- identity=45.8; qcov=0.949; evalue=3.92e-31; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF07939 (DUF1685) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131000915 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057783044.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057783044.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057783044.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057783044.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057783044.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:10574362 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C39 |
Chr8:10574415 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A19,B109,B120,C41 |
Chr8:10574619 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B111,B121,B79 |
Chr8:10574640 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B13 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057783044.1PF07939
DUF1685 49-103 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057783044.1 |
Pfam | PF07939 |
DUF1685 | Family | 49 | 103 | 3.3e-24 | 85.2 | Protein of unknown function (DUF1685) |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。