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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001329`

染色体: Chr08 坐标: 10619952-10623310 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001329`
名称	SmilChr08G001329
描述	uncharacterized SmilChr08G001329
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	10619952 - 10623310 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000860`
GeneID	`131000860`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000860`
原始查询	`SmilChr08G001329`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peptide methionine sulfoxide reductase (Protein of unknown function DUF829, transmembrane 53) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816063]; symbol=AT2G15695; hit=AT2G15695; species=arabidopsis; confidence=high
产物	peptide methionine sulfoxide reductase (Protein of unknown function DUF829, transmembrane 53) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816063]; symbol=AT2G15695; hit=AT2G15695; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G15695` (AT2G15695) peptide methionine sulfoxide reductase (Protein of unknown function DUF829, transmembrane 53) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816063] identity=46.1; qcov=1.08; evalue=1.56e-126; confidence=high
Rice	`Os06g0213400` - identity=42.5; qcov=1.04; evalue=2e-89; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05705 (DUF829)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000860

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057782966.1`
2	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057782966.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057782966.1`
4	Lipid droplet	脂滴	0.20000	`XP_057782966.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782966.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:10620543`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C22,C39
`Chr8:10621208`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B104,B80,C82
`Chr8:10621211`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:10622855`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782966.1

390 aa

195

390

DUF829

PF05705 DUF829 128-359 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782966.1`	Pfam	`PF05705`	DUF829	Domain	128	359	4.5e-09	37.2	Eukaryotic protein of unknown function (DUF829)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926983.1
AGCATAAGATGAAGAATCATTGGCCGGCGAAATGTTCAATAGCCACACATTAGTGATTTTACAATTCAAGCGTGTGTAGTGGTAGACTAGAGCAGCATTAAGTTTTGTGGAATTAAAAATGAGGAAATAAATTGTGGTGGTTTTACAAATATCACTAAGCTATCTGAGGTGGCAAATATCAATCCCGCTCGCCGATCCACCACCAGGACCGCTTCCTCCATCACCTCTCTCTCTCTCTCTCACCTCTTCAGCTCCACAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000860
ATGAGCAGCAGCGGGAGGTACTACTGGGCGCAGAATTGCGGCGACGAGTTTCAAGCTAAAGGAATAGTCGTGGTTTTCGCGTGGGTGTCGTTCAGCGAAGCTCTGCTGAATGATTCTATCAGCTTCTACTCTTCTCTCGGATGGAACTCTTTGGTTTGCCGTTCCAAATATCTCAATCCGTTCTTTCCAGAGAGAGCTACATCCCTTGCTTTTGCTGTCCTAGAAGAGCTTGTCAAGGAGCTCAAAGGTGGATTATGTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782966.1
MSSSGRYYWAQNCGDEFQAKGIVVVFAWVSFSEALLNDSISFYSSLGWNSLVCRSKYLNPFFPERATSLAFAVLEELVKELKGGLCPVVLAAFAGGSKACMYKVLQIIEGCSEVELNMEDRRLVASCISGQIYDSDPIDFTTDLGARFALHRSILKMPGASKLASFLAKGVTSSLDALFLTRFGSQQAEYWQTLYSSVRLGAPFLILCSENEDTVPFSTLCTFAKHLLDVGGTVKIIKRTAAFHLGHHQHQSTQCTAITK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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