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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001333`

染色体: Chr08 坐标: 10661999-10665861 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001333`
名称	SmilChr08G001333
描述	polyadenylate-binding protein RBP47-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	10661999 - 10665861 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000858`
GeneID	`131000858`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000858`
原始查询	`SmilChr08G001333`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	polyadenylate-binding protein RBP47-like
产物	polyadenylate-binding protein RBP47-like
Arabidopsis	`AT1G47490` (RBP47C) RNA-binding protein 47C [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841157] identity=57.5; qcov=0.931; evalue=1.42e-136; confidence=high
Rice	`Os09g0462700` - identity=59.9; qcov=0.809; evalue=8.04e-135; confidence=high
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005829 (cytosol)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000858

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057782962.1`
2	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	1.00000	`XP_057782962.1`
3	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057782962.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.80000	`XP_057782962.1`
5	P-body	P-body	0.40000	`XP_057782962.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:10662258`	`A`	`AGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	9	A13,A4,B103,B138,B46,C10,C14,C40,C81
`Chr8:10662259`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	9	A13,A4,B103,B138,B46,C10,C14,C40,C81
`Chr8:10663547`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C82
`Chr8:10663656`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr8:10663679`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr8:10663683`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr8:10664385`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C82
`Chr8:10664403`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr8:10664518`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,D7
`Chr8:10665316`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr8:10665510`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29
`Chr8:10665619`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,C62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782962.1

392 aa

196

392

RRM_1

PF00076 RRM_1 83-149 aa PF00076 RRM_1 176-245 aa PF00076 RRM_1 277-340 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782962.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	83	149	1.3e-55	185.9	RNA recognition motif
`XP_057782962.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	176	245	1.3e-55	185.9	RNA recognition motif
`XP_057782962.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	277	340	1.3e-55	185.9	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926979.1
ACATAATAAAACACGAAAATCTAAACTAAATCCTATTCCTATCTGTATAACTGTATTAGCATTAGAAGACCTCTCTCTTGGAAAATAAAAATAAAAAAGGAATCCACCCTAGATCCCTAAATATCTCTCTTTATTTTCTCGTCACCCAAACTTGACAAAAATCTCGCTCTCTAGATTCAGAGCGGTTTCCCTACTCTTCCGTAATTCGAGTTTGAAGAGAGGATGAGCGGCGGAGATTCAAATCAGCAGCAGCAGCAGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000858
ATGAGCGGCGGAGATTCAAATCAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGATGCTGCAGCAGCAGCATTGGGCGGCGATGCAGCAGTACCAGCAATGGTGGATGGCGGTGCAGTATCCGGCCATGGCTGCGCAGCACCAAATGATGTATAACCCGCATTACTTGCCATACTACTCCCCCCAGCAGCAACCGAAGCAGTACCCGCCCAAGCACCGCAATCAGATTCAGACTTCCGGCGAGGACAACAAGACAATCTGGATTGGAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782962.1
MSGGDSNQQQQQQQQMLQQQHWAAMQQYQQWWMAVQYPAMAAQHQMMYNPHYLPYYSPQQQPKQYPPKHRNQIQTSGEDNKTIWIGDLQQWMDEDYLHSCFSPTGEVLSVKIIRNRQTGQSDRYGFIEFNSHEAAENALQSYNGTMMPNADQPFRLNWAAFSTGDRRPEAGSDLSIFVGDLAADVTDEQLHETFASRYPSVKDAKVVVDLNTGRSKGYGFVRFNDENEKSRAVTEMNGVQCSSRPMRIGVATPKKYSSQQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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