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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001334`

染色体: Chr08 坐标: 10667496-10669623 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001334`
名称	SmilChr08G001334
描述	serine carboxypeptidase 1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	10667496 - 10669623 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998055`
GeneID	`130998055`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998055`
原始查询	`SmilChr08G001334`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine carboxypeptidase 1-like
产物	serine carboxypeptidase 1-like
Arabidopsis	`AT3G63470` (scpl40) serine carboxypeptidase-like 40 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825522] identity=50.5; qcov=0.923; evalue=3.28e-158; confidence=high
Rice	`Os03g0386700` (OsSCP12) - identity=55.1; qcov=0.95; evalue=5.02e-175; confidence=high
GO	GO:0004185 (serine-type carboxypeptidase activity); GO:0005773 (vacuole); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00450 (Peptidase_S10)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998055

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057779475.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057779475.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779475.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779475.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779475.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:10667552`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B67,B7,C33
`Chr8:10667568`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr8:10667697`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr8:10667747`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr8:10667775`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,A3,B70,B78,C46
`Chr8:10667825`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B67,C33
`Chr8:10667975`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B10,B129,B130,B28,B36,B47,B79,C56
`Chr8:10668164`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr8:10668413`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	A19,B105,B118,B18,B66,B70,B8
`Chr8:10668649`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr8:10668730`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr8:10668894`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779475.1

483 aa

242

483

Peptidase_S10

PF00450 Peptidase_S10 75-476 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779475.1`	Pfam	`PF00450`	Peptidase_S10	Domain	75	476	3e-142	475.6	Serine carboxypeptidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923492.1
ATGAAGTCTGCAACTGCAACTATTTTGCTGCTCTCTCTTGCATGTCTTACAGTTTGCGCTCAATGTTATGGAGGGAGAGCATTTGATCCTCTCACCAAATTTATGAAAGCACGAAGGACAAATACATCACCAAATTATGGTACCACTAAAGATGTCTCAGGCGAATACAGACCAGTTTATGCTGATGAGGGACTCAAGGCAGCTGATATGGTTGTAGGATTGCCGGGGCAACCGCAAGTTAACTTCTCTCAGTATTCAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998055
ATGAAGTCTGCAACTGCAACTATTTTGCTGCTCTCTCTTGCATGTCTTACAGTTTGCGCTCAATGTTATGGAGGGAGAGCATTTGATCCTCTCACCAAATTTATGAAAGCACGAAGGACAAATACATCACCAAATTATGGTACCACTAAAGATGTCTCAGGCGAATACAGACCAGTTTATGCTGATGAGGGACTCAAGGCAGCTGATATGGTTGTAGGATTGCCGGGGCAACCGCAAGTTAACTTCTCTCAGTATTCAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779475.1
MKSATATILLLSLACLTVCAQCYGGRAFDPLTKFMKARRTNTSPNYGTTKDVSGEYRPVYADEGLKAADMVVGLPGQPQVNFSQYSGHVTVDPDAGRALFYYFAESEDSSTKPLVLWLNGGPGCSSLGAGAMTELGPFRVNPDGKTLWYNQYSWNTVANVIFLESPAGVGFSYSNRSSDYNTGDAQTAKDAYTFLVNWLERFPEYKSRDFYITGESYAGHFVPQLASLIMQNNKITNQTVIKLKGIAIGNALVDDEDEDR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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