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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001339`

染色体: Chr08 坐标: 10693163-10694793 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001339`
名称	SmilChr08G001339
描述	uncharacterized SmilChr08G001339
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	10693163 - 10694793 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998057`
GeneID	`130998057`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998057`
原始查询	`SmilChr08G001339`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=52.5; qcov=0.37; evalue=2.43e-32; confidence=low
Rice	`Os06g0597250` - identity=47.3; qcov=1.01; evalue=3.04e-115; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998057

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779476.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779476.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779476.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779476.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057779476.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:10693654`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr8:10693655`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,D7
`Chr8:10693703`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr8:10693753`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	B103,B34,B61,C11,C27,C34,C50,C69,C84
`Chr8:10693759`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr8:10693814`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr8:10693842`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B133,C25
`Chr8:10693886`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr8:10693897`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B17,B6,C40,C7
`Chr8:10693935`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr8:10693969`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B16,B90,C84
`Chr8:10693984`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B16,B34,B40,B90,C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779476.1

386 aa

193

386

DUF8418

Plant_tran

PF28509 DUF8418 51-87 aa PF04827 Plant_tran 153-319 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779476.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	51	87	4.2e-17	62.3	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057779476.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	153	319	2.3e-71	240.4	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923493.1
ATGCCGCACCCGGGTGCAATGGAGGTGGAGCTATGGAACGCTCCTGCTGCGAAGGTGGAGCGAAGGGGATTGGCAAGTTCATATCGTTTCGATCCACCACCATCACGTCCGAGGAAGAAGCGGACAGTGGTTCGTCGTGACCGTGAAGGTGGAGCCGAGCGCCTCCATCGCGATTATTTTTCTGTCGATCCTGTTTATGGGCCACAATTCTTTCACCGTCGATTTCGCATGAGCCGAGAGTTGTTTCTACGCATTGTTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998057
ATGCCGCACCCGGGTGCAATGGAGGTGGAGCTATGGAACGCTCCTGCTGCGAAGGTGGAGCGAAGGGGATTGGCAAGTTCATATCGTTTCGATCCACCACCATCACGTCCGAGGAAGAAGCGGACAGTGGTTCGTCGTGACCGTGAAGGTGGAGCCGAGCGCCTCCATCGCGATTATTTTTCTGTCGATCCTGTTTATGGGCCACAATTCTTTCACCGTCGATTTCGCATGAGCCGAGAGTTGTTTCTACGCATTGTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779476.1
MPHPGAMEVELWNAPAAKVERRGLASSYRFDPPPSRPRKKRTVVRRDREGGAERLHRDYFSVDPVYGPQFFHRRFRMSRELFLRIVDPYFQQRPDAIGRLSFSPIQKCTAAVRQLAYGTAADCCDKYLRIGETTALECLKKFCKAVVRIFGSTYLRRPTAADVQRITAMHEARHGFPGMLGSLDCMHWGWKNCPVAWHGAYTRGDQGEPTIILEAVASQDLWIWHAFFGVAGSNDINVLHQSMLFNDVLAGHEAVVHFLA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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