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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001340`

染色体: Chr08 坐标: 10696372-10701030 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001340`
名称	SmilChr08G001340
描述	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP40-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	10696372 - 10701030 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000868`
GeneID	`131000868`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000868`
原始查询	`SmilChr08G001340`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP40-like
产物	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP40-like
Arabidopsis	`AT2G15790` (SQN) peptidyl-prolyl cis-trans isomerase / cyclophilin-40 (CYP40) / rotamase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816074] identity=77.4; qcov=0.992; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0216800` (OsCYP40a) - identity=78.4; qcov=0.986; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000413 (protein peptidyl-prolyl isomerization); GO:0003755 (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0006457 (protein folding)
KEGG	-
Pfam	PF00160 (Pro_isomerase); PF00515 (TPR_1); PF07719 (TPR_2); PF13181 (TPR_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000868

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057782980.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057782980.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057782980.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782980.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782980.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:10699702`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B80
`Chr8:10699702`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr8:10699836`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr8:10699912`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:10699915`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782980.1

362 aa

181

362

Pro_isomerase

TPR_1

TPR_2

TPR_8

PF00160 Pro_isomerase 8-172 aa PF00515 TPR_1 299-332 aa PF07719 TPR_2 299-332 aa PF13181 TPR_8 299-332 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782980.1`	Pfam	`PF00160`	Pro_isomerase	Domain	8	172	1.9e-49	168.7	Cyclophilin type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase/CLD
`XP_057782980.1`	Pfam	`PF00515`	TPR_1	Repeat	299	332	1.9e-11	43.9	Tetratricopeptide repeat
`XP_057782980.1`	Pfam	`PF07719`	TPR_2	Repeat	299	332	3.1e-12	46.3	Tetratricopeptide repeat
`XP_057782980.1`	Pfam	`PF13181`	TPR_8	Repeat	299	332	2.2e-08	34.3	Tetratricopeptide repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009093809.1
AGCGAGAGGCAGCAGCTTAAGTCTGTGGACATTTGAGCTGAATAAAAGGTAAGAAAGCTCCAAGAGTTGTTTGTTCCAAAATGACAGAAGCCTCCAAGAATTCGAAATACATATAAAGCGGGACTTAGGGTTTTATTTTTTTGACTCTTCCAGACTCTTCTTCTGCTCGCCTATACGTACACCTATATATACAGGCAAACGACCCACAGTCAACGTACACTGTGAGTGAAGGAGAATAGCCATGGGTGGCAGGCCTCGCT...

XM_057926997.1
AGCGAGAGGCAGCAGCTTAAGTCTGTGGACATTTGAGCTGAATAAAAGGTAAGAAAGCTCCAAGAGTTGTTTGTTCCAAAATGACAGAAGCCTCCAAGAATTCGAAATACATATAAAGCGGGACTTAGGGTTTTATTTTTTTGACTCTTCCAGACTCTTCTTCTGCTCGCCTATACGTACACCTATATATACAGGCAAACGACCCACAGTCAACGTACACTGTGAGTGAAGGAGAATAGCCATGGGTGGCAGGCCTCGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000868
ATGGGTGGCAGGCCTCGCTGTTTTTTGGACATTACCATCGGAGACGAGTTGGAAGGGAGGATCATTGTTGAACTGTACAATGATGTAGTCCCCAAAACTGCAGAGAATTTCAGGGCACTTTGTACTGGAGAGAAAGGCATTGGCCCCAACACTGGTGTTCCCCTGCATTACAAGGGGTCCCGTTTTCATCGTGTCATTAAAAGTTTTATGGTACAAGGTGGTGATATATCTGCTGGCGATGGAACTGGAGGGGAATCCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782980.1
MGGRPRCFLDITIGDELEGRIIVELYNDVVPKTAENFRALCTGEKGIGPNTGVPLHYKGSRFHRVIKSFMVQGGDISAGDGTGGESIYGLKFEDENFELKHERKGMLSMANAGPNTNGSQFFITTTRTSHLDAKHVVFGRVIKGMGVVRSAEHVTIGENDCPTVDVVISDCGEILEGADDGTANFFHDGDLFPDWPADLDENSSELSWWVTAVESIKGYGNEHFKKQDYKMALRKYRKALRYLDVCWEKEGIDEDKSQNL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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