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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001347`

染色体: Chr08 坐标: 10776027-10779713 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001347`
名称	SmilChr08G001347
描述	pollen-specific leucine-rich repeat extensin-like protein 3
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	10776027 - 10779713 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998060`
GeneID	`130998060`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998060`
原始查询	`SmilChr08G001347`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pollen-specific leucine-rich repeat extensin-like protein 3
产物	pollen-specific leucine-rich repeat extensin-like protein 3
Arabidopsis	`AT4G33970` (AT4G33970) Leucine-rich repeat (LRR) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829543] identity=46.6; qcov=0.465; evalue=6.53e-141; confidence=medium
Rice	`Os11g0657400` - identity=53.8; qcov=0.303; evalue=5.15e-131; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF08263 (LRRNT_2); PF13855 (LRR_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998060

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.80000	`XP_057779479.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057779479.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057779479.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779479.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779479.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:10776066`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,B24,B25
`Chr8:10776078`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B140,B44,B99,C39,C82
`Chr8:10776167`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	51	A14,A18,A19,A21,A23,A7,A8,B102,B106,B112,B113,B118,B132,B134,B136,B139,B23,B34,B4,B46,B50,B55,B7,B72,B87,B90,B96,C1,C14,C18,C20,C3,C30,C33,C37,C38,C41,C49,C53,C56,C59,C63,C66,C67,C69,C77,C79,C82,C83,C84,C87
`Chr8:10776182`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	51	A14,A18,A19,A21,A23,A7,A8,B102,B106,B112,B113,B118,B132,B134,B136,B139,B23,B34,B4,B46,B50,B55,B7,B72,B87,B90,B96,C1,C14,C18,C20,C3,C30,C33,C37,C38,C41,C49,C53,C56,C59,C63,C66,C67,C69,C77,C79,C82,C83,C84,C87
`Chr8:10776191`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	51	A14,A18,A19,A21,A23,A7,A8,B102,B106,B112,B113,B118,B132,B134,B136,B139,B23,B34,B4,B46,B50,B55,B7,B72,B87,B90,B96,C1,C14,C18,C20,C3,C30,C33,C37,C38,C41,C49,C53,C56,C59,C63,C66,C69,C77,C79,C82,C83,C84,C87,D8
`Chr8:10776192`	`G`	`GGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	52	A14,A18,A19,A21,A23,A7,A8,B102,B106,B112,B113,B118,B132,B134,B136,B139,B23,B34,B4,B46,B50,B55,B7,B72,B87,B90,B96,C1,C14,C18,C20,C3,C30,C33,C37,C38,C41,C49,C53,C56,C59,C63,C66,C67,C69,C77,C79,C82,C83,C84,C87,D8
`Chr8:10776312`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B126
`Chr8:10776555`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,D2,D4
`Chr8:10776825`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C10
`Chr8:10776825`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C10
`Chr8:10776830`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr8:10776924`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779479.1

1079 aa

540

1079

LRRNT_2

LRR_8

LRR_1

PF08263 LRRNT_2 54-86 aa PF13855 LRR_8 124-179 aa PF00560 LRR_1 169-188 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779479.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	54	86	1.9e-05	25.5	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057779479.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	124	179	4.2e-10	40.0	Leucine rich repeat
`XP_057779479.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	169	188	1.2e-14	52.0	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923496.1
ACAGTAAGACTCCAGTGTCTACCTTCCTTTGTCCTTTATTAAAAAACGTTATGCCAAATACATACCATAAGATAAATACAGACTAGTCTTTGCAAAATACTCCAATTTAAGCATTGCAATTACTTTATGAGCTTGAAATCAAATGTATATATAAATAGGGCAGAATTATAGTTAAATTAAAGGAGATAGTAAAACAAAAACAGAATAGATGATTTGAAATGGTGATTTCCATATTTAGCAGTGGCGATAGCATAGAATAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998060
ATGGAAATGAAAACCTTGGGCTGCTGCTTTCTTCTCTTCTTCTCTCTCCTCACATTCCCTTCCTTTGGAACCAAACTCCCCCCGACTTGCAAATGCGACTGTCAAGATGACGAGCCAACCCCAAAGCTAGCCAATCCCAGGCTAGAACGAGCCTACATAGCCCTCCGGGCCTGGAAAAAATCCATCTACTCTGATCCCAATGGCTTCACAACCAATTGGAAGGGCCCCGACGTGTGCAGCTACAACGGCGTCGTCTGCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779479.1
MEMKTLGCCFLLFFSLLTFPSFGTKLPPTCKCDCQDDEPTPKLANPRLERAYIALRAWKKSIYSDPNGFTTNWKGPDVCSYNGVVCAKALDDASIDVVAGIDLNHGDIAGHLPPEIQHLADVSLLHLNSNRFCGIIPEEIKNLKLLFELDVSNNRFVGDFPEVVLELPQLRYLDLRYNEFEGELPPQLFDKPLDAIFLNNNRFHSTIPDNLGNSPASVIVLANNQLYGCIPPSIGKMAGNLDEFVVSHNELSGCLPEEIT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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