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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001352`

染色体: Chr08 坐标: 10831423-10832996 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001352`
名称	SmilChr08G001352
描述	protein JINGUBANG-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	10831423 - 10832996 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000867`
GeneID	`131000867`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000867`
原始查询	`SmilChr08G001352`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein JINGUBANG-like
产物	protein JINGUBANG-like
Arabidopsis	`AT3G18950` (AT3G18950) Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821427] identity=59.6; qcov=0.931; evalue=5.62e-147; confidence=high
Rice	`Os03g0738700` (OsWD40-89) - identity=58; qcov=0.967; evalue=1.8e-137; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000867

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782979.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057782979.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782979.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782979.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782979.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:10831738`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr8:10831833`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr8:10831848`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr8:10831853`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr8:10831935`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr8:10832313`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr8:10832337`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B67,B7,C33
`Chr8:10832541`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,C40
`Chr8:10832564`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B8,C28

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782979.1

364 aa

182

364

WD40

PF00400 WD40 36-61 aa PF00400 WD40 146-174 aa PF00400 WD40 180-215 aa PF00400 WD40 236-263 aa PF00400 WD40 272-305 aa PF00400 WD40 314-360 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782979.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	36	61	4.8e-38	128.7	WD domain, G-beta repeat
`XP_057782979.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	146	174	4.8e-38	128.7	WD domain, G-beta repeat
`XP_057782979.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	180	215	4.8e-38	128.7	WD domain, G-beta repeat
`XP_057782979.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	236	263	4.8e-38	128.7	WD domain, G-beta repeat
`XP_057782979.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	272	305	4.8e-38	128.7	WD domain, G-beta repeat
`XP_057782979.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	314	360	4.8e-38	128.7	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926996.1
AAACTTTAACAATTTATAAGCTTCTGAAAACATTACTCATGTAAGACCAATTAGTCCATAGTATTTAGGGGCTGCATCTAGTGATCACATTTTCCTTTTTATTCATTTTCAACAAAATATAAAGTGTAGTTACTTGATATATTTGAAATTTCTTGTTCCATTTTCGTGGTATAACTATTACATGTCATTATTGAATGTATATTTGTGTAACACTACATTTTATACGTATGATGCTGTACCACGTGTCACTGAGACCCTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000867
ATGATGGTCTCCAATTCCTCCATCTCAAGCTCAGCATCATCAAGCAGCACTACTTCTTCTTCTTCTCCCGAATCCTCATGCCTAATCGGGTCACTCTTCCGGGAAGAAGGGCACATTTATTCCGTGGCGGCCGCTGGGAACATGCTGTACACGGGCTCCGAGAGCAACACCGTGAGAGTGTGGAAAAACTTGCAAGACTTTTCCGGGTTCAAGTCGGCAAGTGGGATGGTGAAAGCCATCGTGGTGCTCAATCAAAAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782979.1
MMVSNSSISSSASSSSTTSSSSPESSCLIGSLFREEGHIYSVAAAGNMLYTGSESNTVRVWKNLQDFSGFKSASGMVKAIVVLNQKIFTGHQDGKIRVWTLLDDHKPAPFNRVGYLPKTKHLLLKSLSPRSYVRVARNRNVPWIKHYDTVSCMSVDAYHGLLYSGSWDKTLKIWRISDSKCLESVAAHDDAVNSVIAAPGGMVFTGSADGTVKAWRREFSGRRTEHFLVDVLLEQEHAVTALAAAGGGRAVYAGSSDGLV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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