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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001358`

染色体: Chr08 坐标: 10873646-10875671 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001358`
名称	SmilChr08G001358
描述	CASP-like protein 5C1
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	10873646 - 10875671 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000920`
GeneID	`131000920`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000920`
原始查询	`SmilChr08G001358`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	CASP-like protein 5C1
产物	CASP-like protein 5C1
Arabidopsis	`AT3G50810` (AT3G50810) Uncharacterized protein family (UPF0497) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824245] identity=49.3; qcov=0.968; evalue=1.87e-46; confidence=medium
Rice	`Os03g0767900` - identity=58.8; qcov=0.877; evalue=3.23e-44; confidence=medium
GO	GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF04535 (CASP_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000920

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057783051.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057783051.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057783051.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783051.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783051.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:10874721`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C53,D4
`Chr8:10874739`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr8:10874984`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B18
`Chr8:10875045`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783051.1

155 aa

155

CASP_dom

PF04535 CASP_dom 8-137 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783051.1`	Pfam	`PF04535`	CASP_dom	Domain	8	137	5.8e-22	78.8	Casparian strip membrane protein domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009093810.1
AAAAACTCTTCAACCAGTTATTAAAAAACAATTGTATCCATTCAAGTATACACTTAGAGATTCCATAACATTATATAGCAGATGAATCCGGGCCATCCATGTATTTGAAAAAAGAAATAAGATGAGATGGGAATACAAAAAGTGAATCTTTATTTTCTCCTACCACGAAATCTCCCACCAACTTTCTTTGTCCAATTAGCACTCAAGCTCTTCGGAAACTTATAAAGTAATCACGAAAGTGGTGAAAACCCGATTCCTGA...

XR_009093811.1
AGCCAAGTTGATCTCACCTTCAAAACTTGCAATGATGGTCTTGGTGAAGACTTGTTGGTGGCAAAACCATGAGAGGAGCTCCGAGCTGGTATATAGAACAAGGCAATAATCAGACGGAAAATCACTACCAGTAGTTTCATTGCGATCACAGCATAAAGCAATGAAAAGTGTACCGGGATCTTTAGGAACAACTGCTAGCATTGCTTTGAGATTTGGGCAGGTCATATTCTCTTCATCGTCTATAGTCTTCATGTCTTTAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000920
ATGAAAAGTGTACCGGGATCTTTAGGAACAACTGCTAGCATTGCTTTGAGATTTGGGCAGGTCATATTCTCTTCATCGTCTATAGTCTTCATGTCTTTAGGAGTTGGATTCTACAGCTACACGGCCTTTTGTTTTTCGGTAACAATCATGGGGCTGGCTATTCCATGGAGTTTCACTTTGGCGATACTCGATGGATATTCCATCCTGGCTAAGTTCCCCGTACATCAATCTGGCATTTTCATGGTTATCATAACAGGGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783051.1
MKSVPGSLGTTASIALRFGQVIFSSSSIVFMSLGVGFYSYTAFCFSVTIMGLAIPWSFTLAILDGYSILAKFPVHQSGIFMVIITGDLVLSFLTLAAASSTASLVDLLLKADVSFCPPRLCSRYQISAAMAFLSWFLLLLSSLSNIWLLPWLDAD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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