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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001364`

染色体: Chr08 坐标: 10885175-10887396 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001364`
名称	SmilChr08G001364
描述	uncharacterized SmilChr08G001364
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	10885175 - 10887396 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998064`
GeneID	`130998064`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998064`
原始查询	`SmilChr08G001364`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	clast3-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821426]; symbol=AT3G18940; hit=AT3G18940; species=arabidopsis; confidence=high
产物	clast3-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821426]; symbol=AT3G18940; hit=AT3G18940; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G18940` (AT3G18940) clast3-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821426] identity=56.5; qcov=0.931; evalue=5.11e-76; confidence=high
Rice	`Os03g0766900` (OSJNBa0079B15.8) - identity=53.3; qcov=0.914; evalue=7.22e-69; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0005829 (cytosol); GO:0043248 (proteasome assembly)
KEGG	-
Pfam	PF09754 (PAC2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998064

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057779481.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057779481.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779481.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779481.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779481.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:10886284`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	A14,B13,B52,B61,B64,B89,C55,C63,C74,D3
`Chr8:10886314`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B64,C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779481.1

232 aa

116

232

PAC2

PF09754 PAC2 41-200 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779481.1`	Pfam	`PF09754`	PAC2	Family	41	200	2.3e-08	34.8	PAC2 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923498.1
ATGAATTTTGGTATATTTAACTATCCAGTGGTGGTATACACCAGTGGTTTGCAGATCTATTTGTTGCAGTATGATGTTAATTTTGTGTATGTGAAATTTGGGATGTTAAATATCACAGCTTATGAATCATCTTCCAGTGCATTGACACTTGTGCAGCAGCGGTCTCCGGGCATGATGGTGGCATATGCTAAGAACATAGCAAATTTTGCAGCTGCTAATGGAAAGAAGCATGTCGTCATACTTTCCAGCTTAGATTTTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998064
ATGAATTTTGGTATATTTAACTATCCAGTGGTGGTATACACCAGTGGTTTGCAGATCTATTTGTTGCAGTATGATGTTAATTTTGTGTATGTGAAATTTGGGATGTTAAATATCACAGCTTATGAATCATCTTCCAGTGCATTGACACTTGTGCAGCAGCGGTCTCCGGGCATGATGGTGGCATATGCTAAGAACATAGCAAATTTTGCAGCTGCTAATGGAAAGAAGCATGTCGTCATACTTTCCAGCTTAGATTTTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779481.1
MNFGIFNYPVVVYTSGLQIYLLQYDVNFVYVKFGMLNITAYESSSSALTLVQQRSPGMMVAYAKNIANFAAANGKKHVVILSSLDFGGLQIYYLSSSNLDGTDAACESLGWKRQQDYDPALRTWKYLDTLAQEVPVPEEDSPLEELGDEDYYPSLPFAALFSCFKAKGLKVTCLFCYCSEGDNIPEAFSMAEAASKLVGLNDFLGDDSGAGKWIAPYSWQSVYGPPADMTLF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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