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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001365`

染色体: Chr08 坐标: 10891801-10894381 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001365`
名称	SmilChr08G001365
描述	protein VACUOLELESS GAMETOPHYTES-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	10891801 - 10894381 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000899`
GeneID	`131000899`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000899`
原始查询	`SmilChr08G001365`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein VACUOLELESS GAMETOPHYTES-like
产物	protein VACUOLELESS GAMETOPHYTES-like
Arabidopsis	`AT2G16050` (AT2G16050) Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816102] identity=63; qcov=0.673; evalue=6.84e-61; confidence=high
Rice	`Os12g0596300` - identity=46.4; qcov=0.873; evalue=9.67e-45; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03107 (C1_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000899

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057783024.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057783023.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057783024.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057783023.1`
5	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057783023.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:10892118`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr8:10892256`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A11
`Chr8:10892256`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A11
`Chr8:10893996`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,C38,C77,D2
`Chr8:10894051`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	11	B136,B16,B23,B68,B81,B87,C13,C18,C29,C43,C49
`Chr8:10894059`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	67	A11,A14,A18,A19,A24,A5,A6,A8,B100,B109,B117,B120,B122,B123,B127,B134,B139,B17,B24,B30,B31,B33,B34,B37,B44,B48,B53,B80,B81,B83,B85,B89,B90,B91,B92,B95,B99,C12,C13,C14,C16,C20,C22,C23,C27,C37,C4,C40,C41,C48,C51,C52,C56,C58,C59,C60,C62,C63,C65,C67,C8,C83,C85,C87,C9,D8,D9
`Chr8:10894182`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783023.1

236 aa

118

236

C1_2

PF03107 C1_2 7-51 aa PF03107 C1_2 68-107 aa

XP_057783024.1

205 aa

102

205

C1_2

PF03107 C1_2 7-51 aa PF03107 C1_2 68-107 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783023.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	7	51	1.3e-17	64.6	C1 domain
`XP_057783023.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	68	107	1.3e-17	64.6	C1 domain
`XP_057783024.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	7	51	3.5e-15	56.8	C1 domain
`XP_057783024.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	68	107	3.5e-15	56.8	C1 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927041.1
TTTACCAATATCATCGTTAGTTTACCCACATACCACTCAATCAAATTAATTAATTTAAAACTCCAATTAAAACAACTTGTAGTTCCTTGTTTCCACAACATATAAAATAAAAAATAGCAGCAATATAATTTTATAAATGAAAAGGTGGAAAGAAGTTGATGGGAGTAAGCCATAACCATAAGCATGAAATACAAAGAAATCTCCCACCACCACACTCTCAAAGTCGGATACGCAGAGGCGCCGTTCAAATGCGACGGCTG...

XM_057927040.1
TTTACCAATATCATCGTTAGTTTACCCACATACCACTCAATCAAATTAATTAATTTAAAACTCCAATTAAAACAACTTGTAGTTCCTTGTTTCCACAACATATAAAATAAAAAATAGCAGCAATATAATTTTATAAATGAAAAGGTGGAAAGAAGTTGATGGGAGTAAGCCATAACCATAAGCATGAAATACAAAGAAATCTCCCACCACCACACTCTCAAAGTCGGATACGCAGAGGCGCCGTTCAAATGCGACGGCTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131000899
ATGAAATACAAAGAAATCTCCCACCACCACACTCTCAAAGTCGGATACGCAGAGGCGCCGTTCAAATGCGACGGCTGCAAGGAGGTGGGCATCGGCTCGTCCTACAAGTGCGGCGGCGCAGCCTGCGACTTCGACCTCCACAGTCACTGCGCCGTTCCTTCTCCCACCCTCCTCCACCCCTTCTACCCAAAGTGCTCGTTCCAGTTCCTCAGCCGCCCGCCGGGGACGGAGGCGCGTTGCTGCAACGCGTGCGAGAGGCG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057783023.1
MKYKEISHHHTLKVGYAEAPFKCDGCKEVGIGSSYKCGGAACDFDLHSHCAVPSPTLLHPFYPKCSFQFLSRPPGTEARCCNACERRVTGFVYHCKLCGFDLHPCCAKLPMMHHDADIKLFLYAKVTAPCHRCGRKGRSWSYRSSCNKYNLHVACVMDMLVDSWHDLYHGDGSGVGRRIPSLKATLETHVNHTKTKGGKAQKCCEMAALALQFVVSAVLGDPTALIAGLVASLISK

XP_057783024.1
MKYKEISHHHTLKVGYAEAPFKCDGCKEVGIGSSYKCGGAACDFDLHSHCAVPSPTLLHPFYPKCSFQFLSRPPGTEARCCNACERRVTGFVYHCKLCGFDLHPCCAKLPMMHHDADIKLFLYAKVTAPCHSGRLQVIQMWEEGEELELQILMQQVQPPRGVRDGHVGGQLARLVPWRWEWGWAANPQPQSHARNSCQSHQNQRR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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